核心结论：针对您描述的“老公和小三利用小规模虚开发票套公司钱”的行为，需从刑事、民事、行政三个层面综合处理，具体如下：

1. 刑事层面：可能构成虚开发票罪或职务侵占罪

• 虚开发票罪：根据《刑法》第205条之一，虚开发票（指为他人、为自己开具与实际经营业务情况不符的发票，或让他人为自己开具、介绍他人开具此类发票）情节严重的，处2年以下有期徒刑、拘役或管制，并处罚金；情节特别严重的，处2年以上7年以下有期徒刑，并处罚金。
  关键点：若虚开发票金额较大（如虚开税款数额1万元以上或虚开发票100份以上），或存在多次虚开、造成国家税款损失等情节，可能被认定为“情节严重”。
• 职务侵占罪：若您老公作为公司员工或管理人员，利用职务便利将公司财物非法占为己有（如通过虚开发票套取资金），数额较大的，构成职务侵占罪（《刑法》第271条）。
  关键点：职务侵占罪的立案标准为数额在6万元以上（不同地区可能略有差异），若套取资金达到该标准，可追究刑事责任。
• 处理建议：立即向公安机关经侦部门报案，提交虚开发票的证据（如发票复印件、资金流向记录、聊天记录等），要求立案侦查。若涉及职务侵占，需证明您老公的职务身份及资金流向的非法性。

2. 民事层面：追回公司损失并主张赔偿

• 公司财产权保护：若您老公和小三的行为导致公司财产损失，公司可作为权利主体，通过民事诉讼要求两人返还套取的资金，并赔偿利息、律师费等损失。
  关键点：需证明资金流向与虚开发票的关联性（如银行流水显示资金转入两人账户），以及公司对资金的所有权。
• 婚姻关系影响：若套取资金用于夫妻共同生活（如购买房产、车辆等），您作为配偶可能被牵连。但根据《民法典》第1064条，若您能证明该债务未用于家庭共同生活，或您对虚开发票行为不知情，可主张不承担连带责任。
  处理建议：若涉及夫妻共同财产分割，可在离婚诉讼中主张对方少分或不分财产（《民法典》第1092条）。

3. 行政层面：税务机关处罚与信用惩戒

• 税务处罚：根据《税收征收管理法》第63条，虚开发票的，由税务机关追缴税款、滞纳金，并处不缴或少缴税款50%至5倍的罚款；构成犯罪的，依法追究刑事责任。
  关键点：即使未达到刑事立案标准，税务机关仍可对虚开发票行为进行行政处罚。
• 信用惩戒：虚开发票行为会被纳入税务信用黑名单，影响个人及企业的征信记录，限制高消费、贷款等。
  处理建议：主动配合税务机关调查，争取从轻处理（如补缴税款、缴纳罚款后申请撤销黑名单）。

4. 证据收集与行动建议

• 关键证据：
  
  1. 虚开发票的原件或复印件；
     
  2. 资金流向记录（银行流水、转账凭证）；
     
  3. 聊天记录、邮件等证明两人合谋的证据；
     
  4. 公司财务制度、审批流程等证明资金非法性的材料。
• 行动步骤：
  
  1. 立即固定证据（如截图、复印）；
     
  2. 向公安机关报案，同步向税务机关举报；
     
  3. 委托律师介入，协助调查取证、与办案机关沟通；
     
  4. 若涉及公司，召开股东会或董事会决议追究责任。

最后提醒：此类行为涉及刑事犯罪，处理需谨慎。建议尽快咨询专业律师，制定全面方案。若您有进一步问题或需要具体指导，可直接向我提问。