公务员的公休日（即周末双休日）不算作年休假中的休息日，二者是相互独立的。以下是对此问题的详细分析：

一、公务员的休息日构成

公务员作为国家机关的工作人员，其休息权益受到法律的严格保障。公务员的休息日主要包括：

1. 法定节假日：如元旦、春节、清明节、劳动节、端午节、中秋节、国庆节等，这些节日期间公务员均享受休假。
2. 周末双休日：公务员遵循双休日制度，即每周工作五天（周一至周五），周六和周日为法定休息日。
3. 带薪年假：根据工作年限的不同，公务员享有不同天数的带薪年假。具体为：累计工作满1年不满10年的，年休假5天；满10年不满20年的，年休假10天；满20年以上的，年休假15天。需要注意的是，国家法定节假日及休息日不计入年休假范畴。

二、公休日与年休假的关系

1. 独立性：公休日（周末双休日）与年休假是相互独立的休息制度。公休日是每周固定的休息时间，而年休假则是根据工作年限给予的额外休息时间。
2. 不计入年休假：根据《职工带薪年休假条例》的规定，国家法定休假日、休息日不计入年休假的假期。这意味着，公务员在享受年休假时，其天数不会因公休日的存在而减少。

三、公务员休息权益的保障

1. 工资福利不变：在年休假期间，公务员的工资和福利待遇不会受到任何影响，与正常工作期间完全相同。
2. 未休年休假的补偿：若公务员因工作原因未能休满其应享有的年休假天数，单位应当按照相关规定支付未休年休假工资报酬。

四、建议与总结

• 合理安排休息时间：公务员应合理安排自己的休息时间，确保在紧张的工作之余能够得到充分的放松与恢复。
• 了解并利用休息权益：公务员应充分了解自己的休息权益，包括法定节假日、周末双休日、带薪年假等，并合理利用这些权益以保持良好的工作状态和生活质量。

综上所述，公务员的公休日（周末双休日）不算作年休假中的休息日。二者是相互独立的休息制度，旨在充分保障公务员的休息权益与身心健康。如有任何关于公务员休息权益的疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。