追尾别人的车导致司机受伤，一般情况下不能使用农村合作医疗进行报销。以下是对此问题的详细分析：
一、农村合作医疗的适用范围
农村合作医疗，即新型农村合作医疗制度，主要是为农村居民提供基本医疗保障，覆盖因疾病或意外伤害导致的医疗费用。然而，其报销范围通常限于因疾病或非第三方责任造成的意外伤害。在涉及第三方责任（如交通事故中的责任方）的情况下，农村合作医疗往往不予报销。
二、交通事故中的医疗费用报销
责任划分：在追尾事故中，如果司机被认定为责任方，那么其因事故导致的医疗费用通常应由责任方自行承担，或者通过其购买的车辆保险（如交强险、商业三者险）进行赔偿。
保险报销：如果司机购买了相应的车辆保险，并且事故在保险范围内，那么司机可以向保险公司申请理赔，以覆盖其因事故导致的医疗费用。
农村合作医疗的限制：由于农村合作医疗主要覆盖非第三方责任造成的医疗费用，因此在涉及交通事故责任的情况下，该制度通常不予报销。这是为了防止道德风险，即避免责任方通过农村合作医疗转嫁其应承担的责任。
三、特殊情况与建议
无责任方或责任方无法赔偿：如果追尾事故中司机无责任，或者责任方无法承担赔偿责任（如逃逸、无保险等），司机可能需要考虑通过其他途径（如社会救助、法律援助等）来寻求医疗费用的报销。但这种情况并不改变农村合作医疗在涉及第三方责任时的基本报销原则。
咨询与核实：由于不同地区的农村合作医疗政策可能存在差异，且具体政策可能随时间调整，因此建议司机在遇到此类问题时，及时咨询当地的新型农村合作医疗管理机构或相关部门，以获取最准确、最权威的信息。
总结与建议：
追尾别人的车导致司机受伤，在一般情况下不能使用农村合作医疗进行报销。司机应首先考虑通过车辆保险进行理赔，或者咨询当地的新型农村合作医疗管理机构以获取更具体的指导。如果有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我将根据具体情况提供专业的法律建议。