公职人员将执业药师证挂在药店里面被查处，可能会受到行政处分、执业资格处罚，情节严重的还可能面临刑事处罚。以下从不同角度进行详细分析：
一、行政处分
公职人员将执业药师证挂靠在药店，并因此获取报酬，这种行为违反了公职人员的廉洁纪律。根据《中国共产党纪律处分条例》和《中华人民共和国公职人员政务处分法》等相关规定，公职人员违规兼职取酬的，视情节轻重，可能会受到警告、记过、记大过、降级、撤职、开除等行政处分。例如，在某案例中，一名公立医院的外科科长因违规将执业药师证挂靠在药店并获取报酬，受到了党内警告处分。
二、执业资格处罚
根据《执业药师注册管理办法》的规定，严禁《执业药师注册证》挂靠。若持证人注册单位与实际工作单位不符，发证部门将撤销其《执业药师注册证》，且三年内不予注册。这意味着，公职人员如果因挂证行为被查处，其执业药师资格可能会被撤销，且在一定期限内无法重新注册。
三、刑事处罚（情节严重时）
虽然挂证行为本身通常不构成犯罪，但如果公职人员以挂证为名收受药店的好处费，且数额较大，就可能涉嫌受贿罪。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，受贿罪是指国家工作人员利用职务上的便利，索取他人财物，或者非法收受他人财物，为他人谋取利益的行为。如果公职人员的挂证行为被认定为受贿，将可能面临刑事处罚，包括有期徒刑、无期徒刑甚至死刑（在情节特别严重的情况下）。不过，需要明确的是，单纯的挂证行为并不等同于受贿，只有当挂证行为与收受财物、为他人谋取利益等要素相结合时，才可能构成受贿罪。
四、其他后果
除了上述行政处分和执业资格处罚外，公职人员还可能因挂证行为面临其他后果。例如，其挂证行为可能被纪检监察部门作为违纪线索进行调查，进而影响其职业发展和个人声誉。此外，如果挂证行为导致药店出现药品安全问题或违规经营行为，公职人员还可能因此承担连带责任。
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