针对您提出的“违规套取专项工作经费怎么处理”这一问题，我会从法律后果、处理流程以及建议措施三个方面进行详细解答。
一、法律后果
违规套取专项工作经费属于严重违法行为，其法律后果主要取决于套取经费的数额、情节以及造成的后果。
行政处罚：一旦套取行为违反财政法规，相关部门会责令改正，追回所套取的经费，并对涉事单位予以警告或通报批评。对于直接负责的主管人员和其他直接责任人员，会依法给予处分，如警告、记过、降级、撤职或开除等。
刑事处罚：若套取经费数额较大，可能涉嫌贪污罪、挪用公款罪、诈骗罪等刑事犯罪。一旦被认定构成犯罪，将面临有期徒刑、拘役，并处罚金等刑事处罚。例如，中国农业大学原教授李某因贪污科研经费被判处有期徒刑十二年，并处罚金人民币300万元。
二、处理流程
违规套取专项工作经费的处理流程通常包括以下几个步骤：
发现与举报：违规行为可能通过内部审计、外部举报或相关部门的检查被发现。
调查与取证：相关部门会成立调查组，对违规行为进行调查，并收集相关证据。
认定与处理：根据调查结果，相关部门会认定违规行为的性质、情节和后果，并依法作出处理决定。处理决定可能包括行政处罚、刑事处罚以及追回套取的经费等。
执行与监督：处理决定执行后，相关部门会进行监督，确保处理决定得到有效执行。
三、建议措施
对于涉事单位和个人，我建议采取以下措施以减轻法律责任：
主动说明情况：涉事单位和个人应及时向相关部门主动说明情况，积极配合调查，以此争取从轻处理。
归还套取经费：尽快采取措施归还套取的经费，以减轻自身法律责任。归还经费是表明悔过态度的重要方式。
加强内部管理：涉事单位应加强内部管理，完善经费使用制度，防止类似违规行为再次发生。例如，可以建立严格的经费审批流程、加强内部审计和监督等。
提高法律意识：涉事单位和个人应提高法律意识，了解并遵守相关法律法规，避免因无知而触犯法律。
总之，违规套取专项工作经费后果严重，必须依法依规处理。涉事单位和个人应积极配合调查，主动归还套取的经费，并加强内部管理，提高法律意识，以避免类似违规行为的发生。希望这些解答能对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。