在建筑资质办理过程中使用工程师的假证件，相关责任主体可能面临行政责任、刑事责任以及民事责任等多方面的法律责任。以下是对这些法律责任的详细分析：
一、行政责任
资质吊销与罚款：
- 根据《建筑业企业资质管理规定》等相关法规，如果企业在申请建筑资质时使用了虚假的工程师证件，一旦被发现，其已取得的建筑资质可能会被吊销。
- 同时，企业还可能面临罚款等行政处罚，罚款金额根据违规情节的严重程度而定，可能从数万元到数十万元不等。
信用惩戒：
- 使用假证件的行为还会被记入企业的信用记录，影响企业的信用评级和未来的市场竞争力。
- 在一些地区，政府还会对失信企业进行公示，进一步损害企业的声誉。
二、刑事责任
伪造、变造、买卖国家机关公文、证件、印章罪：
- 如果工程师的假证件是通过伪造、变造或买卖国家机关公文、证件、印章的方式获得的，那么相关责任主体可能构成此罪。
- 根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，犯此罪的，处三年以下有期徒刑、拘役、管制或者剥夺政治权利，并处罚金；情节严重的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金。
其他相关犯罪：
- 如果使用假证件的行为还涉及其他犯罪活动，如诈骗、行贿等，那么相关责任主体还可能面临其他罪名的指控和相应的刑事处罚。
三、民事责任
合同违约责任：
- 如果企业因为使用假证件而未能按照合同约定完成工程建设任务，那么企业可能需要承担违约责任，包括赔偿发包方因此遭受的损失。
侵权责任：
- 如果使用假证件的行为导致了第三方的人身伤害或财产损失，那么相关责任主体还可能需要承担侵权责任，包括赔偿受害方的损失。
四、建议与措施
- 立即停止使用假证件：一旦发现使用了假证件，企业应立即停止使用，并主动向相关部门报告情况，以减轻可能的法律责任。
- 积极配合调查：在相关部门进行调查时，企业应积极配合，提供真实、完整的资料和信息。
- 加强内部管理：企业应建立健全内部管理制度，加强对员工的教育和培训，防止类似事件再次发生。
- 寻求法律帮助：如果企业面临法律纠纷或处罚，应及时寻求专业律师的法律帮助，以维护自身的合法权益。
使用工程师的假证件在建筑资质办理过程中是严重的违法行为，相关责任主体可能面临多方面的法律责任。因此，建议企业在申请建筑资质时务必遵守相关法律法规，确保所提交的资料真实、合法、有效。如果有任何法律问题，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律建议。