自收自支事业单位在符合法定条件和程序的情况下，是可以发放加班费的。以下是对此问题的详细解析：
一、法律依据与适用情况
《中华人民共和国劳动法》的相关规定：
- 根据《劳动法》第四十四条，用人单位安排劳动者延长工作时间的，应支付不低于工资的百分之一百五十的工资报酬；休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，应支付不低于工资的百分之二百的工资报酬；法定休假日安排劳动者工作的，应支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。
- 适用对象：与自收自支事业单位签订劳动合同并建立劳动关系的劳动者。
- 结论：这类人员加班时，自收自支事业单位应按照《劳动法》规定支付加班费。
事业单位内部规定与政策：
- 自收自支事业单位在加班费发放上可能相对灵活，但需遵循国家关于工作时间和休息休假的总体要求，以及财政纪律和规定。
- 适用对象：自收自支事业单位的所有员工，特别是那些不直接适用《劳动法》特定条款但受单位内部规定约束的员工。
- 结论：自收自支事业单位可以根据自身财务状况和相关规定，制定加班管理制度，并在满足工作需要且经过审批后，按劳动法规定或单位内部规定发放加班费。
二、实际操作中的注意事项
审批与记录：
- 自收自支事业单位安排员工加班时，应确保加班经过审批并有明确的加班任务记录，以作为支付加班费的依据。
薪酬体系与财务管理：
- 自收自支事业单位的薪酬体系和财务管理可能受到单位自身经营状况和特殊性的限制，因此在支付加班费时需考虑这些因素，并遵守相关的财务管理规定。
法律途径维权：
- 如果自收自支事业单位拒绝支付或未按规定支付加班费，员工可以通过法律途径（如劳动仲裁、诉讼等）维护自己的合法权益。
三、地区差异与政策调整
- 不同地区的事业单位可能有不同的薪酬政策和财务管理规定，因此在处理加班费问题时需结合当地的法律法规和政策文件进行判断和处理。
- 随着法律法规的不断完善和政策的调整，自收自支事业单位加班费的支付标准和方式也可能发生变化，因此在实际操作中需及时关注相关法规和政策的变化。
建议：自收自支事业单位应建立健全加班管理制度，明确加班费的支付标准和方式，并确保符合相关法律法规和政策要求。同时，员工也应了解自己的权益，并在必要时通过法律途径维护自己的合法权益。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。