结论：主合同上有本人签名，但身份证复印件由他人代签，而本人按了指纹的情况，其法律效力需结合具体情况分析，一般而言，本人按指纹的行为可视为对合同或相关事项的确认，具有法律效力，但需注意是否存在欺诈、胁迫等情形。以下从不同角度进行详细分析：

一、指纹的法律效力

1. 指纹作为身份确认的方式：

   • 指纹具有唯一性，是确认个人身份的重要方式之一。在法律文书中，指纹通常被视为个人真实意思表示的确认。
   • 若本人在身份证复印件上按指纹，且该行为是在自愿、真实的情况下进行，那么该指纹可以视为对身份证复印件内容或相关合同事项的确认。

2. 指纹与签名的关系：

   • 签名和指纹都是确认个人身份和真实意思表示的方式。在合同中，签名通常被视为主要的确认方式，但指纹同样具有法律效力。
   • 若合同上有本人签名，且身份证复印件上有本人指纹，即使身份证复印件上的签名由他人代签，该指纹仍可视为对合同或相关事项的补充确认。

二、他人代签身份证复印件的法律问题

1. 代签行为的合法性：

   • 他人代签身份证复印件本身并不直接违法，但关键在于代签行为是否得到了本人的授权或同意。
   • 若代签行为未经本人授权或同意，且该代签行为导致了不良后果（如合同纠纷、身份盗用等），则代签人可能承担相应的法律责任。

2. 代签行为对合同效力的影响：

   • 若合同上有本人签名，且身份证复印件上的指纹也是本人所按，即使身份证复印件上的签名由他人代签，该合同仍可能被视为有效。因为指纹和签名共同构成了对合同内容的确认。
   • 但若存在欺诈、胁迫等情形，导致本人在非自愿的情况下按了指纹或签了名，则该合同可能被视为无效或可撤销。

三、法律建议

1. 核实合同内容：

   • 在签署任何合同前，务必仔细阅读合同内容，确保理解并同意合同中的所有条款。
   • 若发现身份证复印件上的签名由他人代签，应立即核实该代签行为是否得到了本人的授权或同意。

2. 保留证据：

   • 若担心合同效力问题，建议保留与合同签署相关的所有证据，如签署时的照片、视频、录音等。
   • 这些证据可以在后续发生纠纷时，作为证明本人真实意思表示的依据。

3. 寻求法律帮助：

   • 若对合同效力或相关法律问题存在疑问，建议及时咨询专业律师，以获取准确的法律意见。
   • 律师可以根据具体情况，分析合同效力、法律责任等问题，并为您提供相应的法律建议。

总结：主合同上有本人签名，但身份证复印件由他人代签，而本人按了指纹的情况，其法律效力需结合具体情况分析。一般而言，本人按指纹的行为可视为对合同或相关事项的确认，具有法律效力。但为确保合同的有效性和自身权益，建议在签署合同前仔细核实合同内容，并保留相关证据。如有任何疑问或担忧，请及时向我咨询。