在为员工垫付欠薪之后，工资通常由劳动行政部门或法院指定的相关部门代发，具体取决于欠薪追回的方式和程序。以下是对此问题的详细分析：

一、劳动行政部门代发

1. 劳动监察介入：当企业拖欠员工工资时，员工可以向当地劳动行政部门（如劳动监察大队）投诉。劳动行政部门在调查核实后，会责令企业限期支付工资。若企业逾期不支付，劳动行政部门有权采取进一步措施。

2. 代发工资程序：在劳动行政部门介入并确认企业欠薪事实后，若企业无法或拒绝支付工资，劳动行政部门可能会协调相关部门（如银行、财政部门等）代发工资。这种情况下，代发工资的资金可能来源于政府垫付、企业缴纳的欠薪保障金或其他合法来源。

二、法院指定部门代发

1. 劳动争议仲裁或诉讼：若员工与企业之间的欠薪争议无法通过协商或劳动监察解决，员工可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，或直接向法院提起诉讼。

2. 执行阶段代发：在仲裁或诉讼胜诉后，若企业仍不履行支付工资的义务，员工可以向法院申请强制执行。法院在执行过程中，可能会指定相关部门（如法院执行局、银行等）代发工资。这种情况下，代发工资的资金通常来源于法院从企业账户中划拨的款项，或企业提供的担保财产变现所得。

三、特殊情况下的代发

1. 政府垫付：在某些地区，政府可能设立了欠薪保障基金，用于垫付企业拖欠的员工工资。在这种情况下，政府相关部门（如人力资源和社会保障局）会负责代发工资。

2. 第三方机构代发：在极少数情况下，若企业欠薪问题涉及复杂的社会关系或法律程序，法院或劳动行政部门可能会委托第三方机构（如律师事务所、会计师事务所等）代发工资。但这种情况较为罕见，且通常需要严格的法律程序和监管。

法律建议

• 及时投诉与维权：若您遇到企业拖欠工资的情况，建议及时向当地劳动行政部门投诉，并保留好相关证据（如工资条、劳动合同等）。

• 关注执行进展：若通过仲裁或诉讼胜诉后，企业仍不履行支付工资的义务，请密切关注法院的执行进展，并配合法院的工作。

• 咨询专业律师：在处理欠薪问题时，若遇到复杂的法律问题或程序，建议咨询专业律师以获取更全面的法律建议和帮助。

若您在处理员工垫付欠薪及后续工资代发问题上有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。