针对您提出的“乡镇人民政府与光伏企业签订排他性合作协议，并明确政府工作经费是否合法”的问题，我们需要从多个角度进行深入分析。

首先，关于排他性合作协议的合法性，这主要取决于协议的具体内容、签订程序以及是否违反相关法律法规。排他性协议本身并不必然违法，但如果协议内容限制了市场竞争、排除了其他合法经营者的竞争机会，或者违反了反垄断法等相关规定，那么该协议就可能面临法律挑战。因此，在签订排他性合作协议时，乡镇人民政府需要确保协议内容合法合规，不违反市场竞争原则。

其次，关于政府工作经费的明确问题，这涉及到政府财政支出的透明度和合规性。政府工作经费是政府为履行其职能而支出的费用，其使用应当遵循公开、透明、合规的原则。如果乡镇人民政府在与光伏企业的合作协议中明确政府工作经费，那么需要确保这些经费的使用符合相关法律法规和财政纪律，且经过合法的预算和审批程序。同时，政府工作经费的明确不应当成为企业获取不正当利益或政府滥用职权的手段。

结合您提供的参考信息，我们可以看到，国家对于涉企收费有着严格的监管机制，包括建立健全涉企收费目录清单制度、完善涉企收费政策评估审核工作机制等。这些措施旨在规范涉企收费行为，降低企业经营成本，优化营商环境。因此，乡镇人民政府在与光伏企业签订合作协议时，也需要遵循这些原则，确保协议内容不违反国家关于涉企收费的相关规定。

综上所述，乡镇人民政府与光伏企业签订排他性合作协议并明确政府工作经费是否合法，取决于协议的具体内容、签订程序以及是否违反相关法律法规和财政纪律。为了确保合法合规，乡镇人民政府在签订协议前应当进行充分的法律审查和风险评估，并遵循国家关于涉企收费的相关规定。如果协议内容合法合规且经过合法的预算和审批程序，那么该协议就是合法的。