关于工厂里员工违章罚款是否合法的问题，这确实是一个需要细致分析的情况。首先，我们可以明确地说，工厂对员工违章进行罚款的合法性并非绝对，而是取决于多个因素。

合法性判断的关键因素

1. 规章制度依据：

   • 工厂罚款必须基于合法、有效且经过民主程序制定的规章制度。这些规章制度应当明确罚款的条件、金额和程序，并且已经向员工进行了公示或告知。
   • 如果规章制度缺乏合法依据，或者制定程序不合法（如未经民主讨论、未公示等），那么基于此的罚款则可能是不合法的。

2. 罚款目的合理性：

   • 罚款的目的应当是为了维护正常的生产秩序、保障员工安全或弥补公司因员工违章行为造成的损失等合理目的。
   • 如果罚款的目的被滥用，如为了惩罚员工或增加公司收入，那么这种罚款则可能缺乏合理性。

3. 罚款金额合理性：

   • 罚款的金额应当合理，不得过高，以免对员工造成过大的经济负担。
   • 罚款金额应当与员工违章行为的严重程度相匹配，体现过罚相当的原则。

4. 程序正当性：

   • 罚款程序应当正当，包括给予员工申辩的机会、听取员工的陈述和申辩等。
   • 如果罚款程序不规范，如未给予员工申辩机会或未听取员工意见，那么这种罚款则可能缺乏正当性。

合法与不合法的具体情形

• 合法情形：

  • 如果工厂依据依法制定并公示的规章制度对员工违章进行罚款，且该规章制度内容合法合理，不违反法律强制性规定，同时罚款目的合理、金额合理、程序正当，那么这种罚款是合法的。

• 不合法情形：

  • 如果工厂无合法有效的规章制度作依据，或规章制度制定程序不合法，或者罚款目的不合理、金额过高、程序不规范（如未给予员工申辩机会等），那么这种罚款则是不合法的。

员工权益保护

• 如果员工认为工厂的罚款不合法，有权拒绝缴纳，并可以通过与工厂协商、向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁等合法途径来维护自身权益。

综上所述，工厂里员工违章罚款是否合法，关键在于其依据的规章制度是否合法以及罚款的实施过程是否符合法律规定。因此，在面对此类问题时，建议员工先了解工厂的规章制度和罚款程序，再根据自身情况判断罚款的合法性，并采取相应的维权措施。