关于工期延期违约金每天最高扣多少的问题，这并非一个由法律统一规定的固定数值，而是需要依据合同双方的约定以及实际情况来综合确定，同时需遵守《民法典》中关于违约金数额合理性的相关规定。
一、合同有明确约定的情况
如果合同中已经明确约定了工期延误违约金的具体数额或计算方法（例如按工程总额的固定比例按天计算，或者根据工程款总额在延期超出约定期限后按天计算等），并且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么应按照合同约定来执行。这种情况下，违约金的数额完全取决于合同双方的协商结果。
二、合同没有约定或约定不明的情况
参考行业惯例：在某些特定行业中，可能存在关于工期延误违约金的行业惯例。但需要注意的是，这种惯例需要有充分的证据证明其存在和被广泛认可。如果行业内有普遍接受的违约金计算方式或标准，可以作为参考。
根据实际损失确定：当合同中没有明确约定或约定不明确时，可以根据因工期延误导致的实际损失来确定违约金数额。这包括发包方因赶工期而额外支付的费用（如人工成本、设备租赁成本等）以及因无法按时投入使用而遭受的收益损失。在这种情况下，违约金的数额应与实际损失相当。
三、法律限制
根据《民法典》第五百八十五条的规定，约定的违约金应当与因违约造成的损失相当。如果约定的违约金低于造成的损失，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以增加；反之，如果约定的违约金过分高于造成的损失（一般超过损失的30%可能被视为“过分高于”），人民法院或者仲裁机构也可以根据当事人的请求予以适当减少。这意味着，即使合同中有约定，违约金的数额也可能受到法律的调整。
四、实际操作建议
优先审查合同条款：在签订合同时，应明确工期延误违约金的计算方式、上限以及免责情形，以避免后续争议。
保留证据链：无论是发包方还是承包方，都应保留好与工期延误相关的证据，如额外租赁费用凭证、不可抗力证明等，以便在需要时提供证明。
协商与调解：出现工期延误时，双方应及时沟通调整计划，避免纠纷升级。如果可能的话，可以通过协商或调解的方式解决争议。
法律救济途径：如果协商未果，双方可以通过仲裁或诉讼的方式解决争议。但需要注意的是，诉讼时效通常为3年，因此应及时行使权利。
总结：工期延期违约金每天最高扣多少并没有一个固定的答案，而是需要根据合同双方的约定、实际损失情况以及法律法规的相关规定来综合确定。建议在签约前明确条款，发生争议时优先通过协商解决，必要时寻求专业法律支持。