公用设施的风机装在商铺内是否违法，需结合具体法律法规和实际情况来判断。

一. 法律法规分析

1. 《大气污染防治法》相关规定：根据《大气污染防治法》第81条，未配备设立专用烟道的商住综合楼以及商住综合楼内与居住层相邻的商业楼层内，禁止新建、改建、扩建产生油烟、异味、废弃物的餐饮服务项目。此条款主要关注的是油烟、异味、废弃物的排放，对于风机的安装位置并未直接规定。但风机若与油烟排放相关，且未按照规定安装，可能间接违反此条款。

2. 其他相关法律法规：在公用设施的安装和使用上，通常还需遵循建筑规划、消防安全、环境保护等多方面的法律法规。风机作为设备的一部分，其安装位置和使用需符合相关标准和规定，不得对周边居民造成不良影响。

二. 实际情况分析

1. 风机安装位置：风机安装在商铺内，若其运行产生的噪音、震动等对居民生活造成影响，如案例中所述，则可能构成违法。此时，需考虑风机的安装是否符合相关环保和建筑规划标准。

2. 审批与整改：案例中提到，商铺在自建烟道并安装风机后，因噪音和低频震动问题被投诉。经整改后，虽然噪音和油烟排放达到标准，但低频震动问题仍存在。这表明，风机的安装和使用可能未经充分审批或未完全按照审批要求进行，存在违规风险。

综上所述，公用设施的风机装在商铺内是否违法，需综合考虑法律法规和实际情况。若风机的安装和使用违反了相关法律法规或标准，如产生噪音、震动等影响居民生活，或未按照规定进行审批和整改，则可能构成违法。因此，我建议在实际操作中，应严格按照相关法律法规和标准进行风机的安装和使用，确保不对周边居民造成不良影响。如有进一步需要，您可以继续咨询我。