针对“违法住改商，责令整改由谁做出”的问题，我可以明确地告诉你：住改商责令整改的主体通常是县级以上人民政府房地产行政主管部门或城市管理部门。以下是详细的解释：

1. 房地产行政主管部门：

   • 负责房地产市场的管理和监督，包括对各类房屋使用行为的规范。
   • 当发现住改商等违反规定的行为时，该部门有权依据相关法律法规，责令业主或使用人停止违法行为并进行整改。

2. 城市管理部门：

   • 主要负责城市市容市貌、环境卫生等方面的管理工作。
   • 住改商可能会对周边环境和居民生活造成影响，因此城市管理部门也可能在其职责范围内对住改商行为进行监管，并依据相关规定采取措施进行整改。

具体由哪个部门负责责令整改，要根据当地的管理体制和职责划分来确定。如果你面临这样的情况，建议首先咨询当地的房地产行政主管部门或城市管理部门，了解具体的整改要求和流程。

希望这个解答能帮到你，如果你还有其他房产相关的问题，或者需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。