强制医疗案件撤销后，一般不会留下案底。以下是对此问题的详细分析：

一、案底的形成与撤销案件的关系

案底，通常指的是犯罪记录，即个人因犯罪行为被法院定罪量刑后留下的记录。而撤销案件，则意味着在侦查或审理过程中，发现案件不符合继续追究刑事责任的条件，因此决定终止对案件的进一步处理。在强制医疗案件中，如果案件被撤销，说明并未对涉案人进行定罪量刑，因此不会留下案底。

二、强制医疗案件撤销的具体情形

强制医疗案件的撤销，可能基于多种原因，包括但不限于：

1. 没有犯罪事实：经过侦查，确认没有发生犯罪行为或犯罪嫌疑人并非真正实施者。
2. 情节显著轻微、危害不大：虽然存在犯罪事实，但情节轻微，社会危害性小，不认为是犯罪。
3. 犯罪已过追诉时效期限：犯罪行为已经超过法律规定的追诉期限，不再追究犯罪嫌疑人的刑事责任。
4. 其他依法不追究刑事责任的情形：如犯罪嫌疑人未达到刑事责任年龄、经特赦令免除刑罚、犯罪嫌疑人死亡等。

在这些情形下，如果强制医疗案件被撤销，涉案人不会留下案底。

三、撤销案件后的法律后果

1. 无犯罪记录：撤销案件后，涉案人的个人档案中不会记录有犯罪行为，因此不会影响其未来的就业、升学等。
2. 释放与通知：在侦查阶段，一旦发现不应对犯罪嫌疑人追究刑事责任的情形，公安机关应当立即撤销案件，并释放已被逮捕的犯罪嫌疑人，同时通知原批准逮捕的人民检察院。

四、特殊情况下的考虑

虽然强制医疗案件撤销后一般不会留下案底，但也有一些特殊情况需要考虑。例如，如果涉案人在案件处理过程中存在其他违法行为，或者案件撤销后发现新的证据证明其有罪，那么可能会面临进一步的法律追究。然而，这些情况并不改变撤销案件本身不会留下案底的基本事实。

建议：如果您或您身边的人遇到了强制医疗案件被撤销的情况，且担心是否会留下案底，可以放心。在正常情况下，撤销案件不会留下案底。但如果您对具体情况有疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。