结论：在医药费由全责方垫付，另一方无责但报工伤的情况下，赔偿款项的归属需根据具体情况判断，一般原则是赔偿应覆盖实际损失且不重复获赔，具体可能给到受伤员工或用于冲抵全责方垫付费用。
分析说明：
工伤赔偿的基本原则：
- 工伤赔偿旨在覆盖员工因工作受伤所产生的医疗费用、误工费、伤残补助等实际损失。
- 若员工已从全责方获得医疗费用的垫付，则在工伤赔偿中，该部分费用通常不再重复支付给员工，以避免重复获赔。
全责方垫付医药费的性质：
- 全责方垫付医药费，通常视为其对事故责任的承担，或出于人道主义救助。
- 垫付行为并不改变工伤赔偿的法律性质，即员工仍有权依法获得工伤赔偿。
赔偿款项的可能归属：
- 给到受伤员工：若工伤赔偿中除医疗费用外，还包括误工费、伤残补助等其他项目，且这些项目未被全责方垫付，则赔偿款项（扣除已垫付的医疗费用部分）应给到受伤员工。
- 用于冲抵全责方垫付费用：在实际操作中，若工伤赔偿机构或用人单位与全责方协商一致，也可将工伤赔偿中的医疗费用部分直接用于冲抵全责方已垫付的费用，以避免资金流转的繁琐。但这种情况需要各方明确同意，并确保员工的合法权益不受损害。
特殊情况的处理：
- 若全责方垫付的医药费超出了其应承担的责任范围，或存在其他争议点（如责任划分不清、垫付行为是否合法等），则可能需要通过法律途径解决，包括诉讼或仲裁等。
- 在此过程中，应确保员工的合法权益得到充分保障，避免因责任划分或资金流转问题而损害员工的利益。
行动建议：
- 明确各方责任：首先，应明确事故责任划分，确定全责方和无责方的具体责任范围。
- 协商处理：各方应积极协商，就赔偿款项的归属、冲抵方式等问题达成一致意见。
- 依法处理：若协商无果，或存在法律争议，应及时寻求法律援助，通过法律途径解决纠纷。
法律背景：
- 根据《工伤保险条例》及相关法律法规，员工因工作受伤有权依法获得工伤赔偿。
- 赔偿款项的归属应遵循公平、合理、不重复获赔的原则，确保员工的合法权益得到充分保障。
在处理此类问题时，建议各方保持沟通畅通，积极协商解决争议，以维护员工的合法权益和社会的和谐稳定。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。