在假冒注册商标罪刑事案件中，商标侵权的鉴定通常由工商行政管理部门、海关部门以及公检法司法机关等部门根据各自的职责和程序进行认定。以下是对这些部门在商标侵权认定中的具体角色和程序的详细说明：
工商行政管理部门：
- 角色：工商行政管理部门是商标侵权认定的主要行政部门之一。它们负责监管市场，查处侵犯注册商标专用权的行为。
- 程序：当接到商标侵权的投诉或发现侵权行为时，工商行政管理部门会进行调查取证，包括现场检查、询问当事人、查阅相关资料等。如果认定侵权行为成立，它们会责令侵权人立即停止侵权行为，没收、销毁侵权商品和制造工具，并处以罚款。
海关部门：
- 角色：海关部门在进出口环节中扮演着重要角色，负责监管进出口货物，防止侵权商品进出境。
- 程序：商标权利人可以向海关总署申请知识产权备案。海关在监管中发现涉嫌侵权货物时，会通知商标权利人并协助调查。经查实后，海关将依法扣留并没收侵权货物，并可对侵权人处以罚款等行政处罚。
公检法司法机关：
- 公安部门：负责对涉嫌构成假冒注册商标犯罪案件的立案侦查工作，收集证据，抓捕犯罪嫌疑人。
- 检察院：负责商标侵权刑事案件的审查批捕、起诉等工作，确保案件符合法律程序。
- 法院：负责审理商标有关的行政、民事、刑事案件。在刑事案件中，对于情节严重、构成犯罪的假冒商标侵权行为，法院将依法进行审判，追究侵权人的刑事责任。
在刑事案件中，特别是涉及假冒注册商标罪的案件，商标侵权的认定往往更加严格和细致。因为这类案件不仅涉及民事侵权，还可能涉及刑事犯罪。因此，除了工商行政管理部门和海关部门的行政认定外，公安部门、检察院和法院也会根据各自的职责和程序进行深入的调查和审判。
对于商标权利人而言，如果发现假冒注册商标的行为，应及时向相关部门举报，并提供充分的证据。相关部门会根据证据和法律规定进行认定和处理。同时，商标权利人也可以咨询专业律师，了解自己的权利和义务，以及如何更好地维护自己的商标权益。
如果您在假冒注册商标罪刑事案件中遇到商标侵权鉴定的问题，或者需要了解更多关于商标保护的法律知识，可以直接向我咨询。我会根据您的具体情况，提供全面、专业的法律建议。