招投标程序方面的争议，其案由及管辖的确定需根据争议的具体性质来分析。以下是从不同角度对这一问题的详细解答：
一、案由的确定
招投标程序方面的争议，可能涉及的案由包括但不限于：
- 招标文件争议：涉及招标文件的合法性、合规性、条款解释等方面的争议。
- 招标过程争议：涉及招标流程是否公开、公平、公正，是否存在违规操作等方面的争议。
- 中标结果争议：涉及中标结果是否合法有效，是否存在串通投标、弄虚作假等行为的争议。
根据《民事案件案由规定》，与招标投标活动有关的民事争议还包括因招标投标活动引起的缔约过失责任纠纷、确认合同效力纠纷、招标投标买卖合同纠纷以及串通投标不正当竞争纠纷等。这些案由的选择取决于争议的具体内容和性质。
二、管辖的确定
招投标程序方面的争议，其管辖法院的确定需根据争议的性质和法律规定来综合判断：
合同纠纷管辖：
- 如果争议属于合同纠纷，如因招标投标活动引起的缔约过失责任纠纷、确认合同效力纠纷、招标投标买卖合同纠纷等，应根据《民事诉讼法》关于合同纠纷管辖的规定来确定有管辖权的法院。
- 具体来说，由被告住所地或者合同履行地人民法院管辖。但当事人在不违反《民事诉讼法》关于级别管辖和专属管辖的规定的前提下，可以书面协议选择被告住所地、合同履行地、合同签订地、原告住所地、标的物所在地等与争议有实际联系的地点的人民法院管辖。
- 需要注意的是，如果合同性质认定不同，会导致合同履行地不同，从而影响管辖法院的确定。例如，建设工程施工合同纠纷应按不动产纠纷确定由不动产所在地人民法院管辖。
侵权纠纷管辖：
- 如果争议属于侵权纠纷，如串通投标不正当竞争纠纷，原则上由侵权行为地或者被告住所地人民法院管辖。
- 但法律或者司法解释作出特别规定的除外，此时应按照特别规定来确定管辖法院。
三、建议与注意事项
事先约定争议解决方式：
- 建议当事人在招标文件与合同中事先选择争议解决方式，并依法起草好纠纷解决条款。这有助于在发生争议时快速、有效地解决纠纷。
认真研究法律规定：
- 如果事先没有约定争议解决方式，当事人在发生纠纷后应认真研究法律的相关规定，依法保护自己的合法权益。
及时寻求法律帮助：
- 招投标程序方面的争议可能涉及复杂的法律问题和事实认定，建议当事人在必要时及时寻求专业律师的法律帮助。
举例来说，如果一家公司在招投标过程中认为招标流程存在违规操作，导致其中标无效，那么该公司可以依据相关法律规定，向有管辖权的人民法院提起诉讼，要求确认中标结果无效并赔偿损失。此时，案由可能选择为“招标过程争议”或“中标结果争议”，而管辖法院则根据合同纠纷或侵权纠纷的管辖规定来确定。
综上所述，招投标程序方面的争议其案由及管辖的确定需根据争议的具体性质和法律规定来综合判断。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。