停工留薪期违反公司规章制度，公司是否可以辞退，需分情况讨论：
一、停工留薪期未满时
一般情况下，公司不能辞退：
- 根据《工伤保险条例》及相关规定，职工因工作遭受事故伤害或者患职业病需要暂停工作接受工伤医疗的，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。此期间，用人单位不得依照无过失性辞退、经济性裁员的规定与工伤职工解除劳动合同。
例外情形：员工存在严重过失：
- 如果员工在停工留薪期内存在严重违反用人单位规章制度、严重失职给用人单位造成重大损害等过失性辞退情形，公司可以依据《劳动合同法》第三十九条的规定解除劳动合同，且无需支付经济补偿。但公司需承担举证责任，证明员工确实存在严重违反规章制度的事实。
二、停工留薪期满后
员工恢复劳动能力却拒不返岗：
- 若员工在停工留薪期满后已恢复劳动能力，能够从事原工作或单位另行安排的工作，却拒不返岗工作，且单位规章制度明确此种情形属于严重违纪，单位有权依据《劳动合同法》第三十九条的规定，以严重违反用人单位规章制度为由辞退员工，且无需支付经济补偿。
员工仍无法工作：
- 若员工因工伤等原因，在停工留薪期满后仍无法工作，单位需按法定程序进行处理。根据《劳动合同法》第四十条的规定，单位可以提前三十日以书面形式通知员工本人，或者额外支付员工一个月工资后，解除劳动合同，但要依法支付经济补偿。经济补偿按员工在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向员工支付。
员工存在严重过失：
- 无论停工留薪期是否已满，只要员工存在严重违反公司规章制度、严重失职等《劳动合同法》规定的过错情形，公司都有权依法辞退，且无需支付经济补偿。
三、法律建议
- 对于公司：在辞退员工前，务必确保员工存在严重违反规章制度的事实，并保留相关证据。同时，需遵循法定程序，避免违法辞退带来的法律风险。
- 对于员工：若认为公司辞退行为违法，可要求公司继续履行劳动合同，或要求公司支付违法解除劳动合同的赔偿金。赔偿金按经济补偿标准的二倍计算。
举例说明：
- 假设员工小李在停工留薪期内因私自外出导致工伤复发，严重违反了公司的规章制度。公司在此情况下，有权依据规章制度辞退小李，且无需支付经济补偿。
- 假设员工小张在停工留薪期满后已恢复劳动能力，但拒绝返岗工作。公司规章制度明确规定，拒不返岗属于严重违纪。在此情况下，公司有权辞退小张，且无需支付经济补偿。
总结：停工留薪期违反公司规章制度，公司是否可以辞退，需根据员工的具体情况、停工留薪期的状态以及公司规章制度的约定来综合判断。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。