在面对大股东决定注销公司，但法人不配合的情况下，公司仍可通过一系列法定程序完成注销。以下是具体的操作步骤和法律依据：
一. 前置沟通与协商
- 了解法人不配合原因：首先，应尝试与法人进行深入沟通，了解其不配合注销的具体原因，可能是对注销流程的不了解、担心个人责任或是对公司资产分配有异议等。
- 说明注销必要性：向法人详细阐述注销公司的必要性，以及不注销可能带来的法律后果，如公司可能被列入异常经营名录，影响法人的个人信用等。
二. 依据公司章程与法律程序推进
- 查阅公司章程：仔细审查公司章程中关于公司注销的相关规定，确保注销流程的合规性。
- 股东会决议：根据《公司法》的规定，召集股东会就注销事宜进行讨论并表决。只要达到法定多数（通常是三分之二以上）的股东同意，即可形成有效的注销决议。此决议具有法律效力，可作为后续办理注销手续的依据。
- 成立清算组：按照《公司法》第一百八十三条的规定，在解散事由出现之日起十五日内成立清算组，开始清算。清算组负责编制资产负债表和财产清单，制定清算方案，并报股东会或人民法院确认。
三. 法律途径的保障
- 向登记机关反映：若法人仍不配合，可向公司登记机关（如工商行政管理局）反映情况，并提交相关证据，如公司章程、股东决议等，请求登记机关协助处理。
- 提起诉讼：若通过上述方式均无法解决问题，大股东可依法向法院提起诉讼，请求法院判令法人履行配合注销的义务。在诉讼过程中，需准备充分的证据，如公司章程、股东决议、书面通知及送达凭证等，以证明注销的合法性和必要性。
四. 其他备选方案
- 股权转让：在可能的情况下，大股东可考虑与法人协商，通过股权转让的方式让法人退出公司，从而规避注销过程中的障碍。
- 变更法人：若符合法定条件和程序，可通过股东会决议变更法人，由新法人配合完成公司注销工作。
结论：在面对大股东决定注销公司，但法人不配合的情况下，公司应首先尝试通过沟通与协商解决问题。若协商无果，则可依据公司章程和法律程序推进注销工作，并在必要时通过法律途径寻求保障。在整个过程中，务必注重证据的收集和保留，以确保注销流程的顺利进行。如有进一步需要，您可以继续咨询我。