针对一审法院认定协议与补充协议事实清楚，但判决未计算补充协议内容的情况，上诉状可以这样撰写：
一、上诉状的基本结构
上诉状通常包括以下几个部分：标题、上诉人信息、被上诉人信息、案由、上诉请求、事实与理由、结尾及落款。
二、上诉请求的具体内容
在上诉请求部分，应明确指出一审判决的错误，并请求二审法院依法改判。具体可表述为：
“一、请求撤销一审法院关于未计算补充协议内容的判决部分；
二、请求二审法院依法重新计算并认定补充协议的内容，并据此作出公正判决；
三、请求二审法院判令被上诉人承担本案的全部诉讼费用。”
三、事实与理由的详细阐述
在事实与理由部分，应详细阐述一审判决未计算补充协议内容的错误所在，以及补充协议的重要性和对案件结果的影响。以下是一个详细的撰写示例：
（一）一审判决未计算补充协议内容，属于事实认定不清
一审法院在判决中明确认定了协议与补充协议的事实清楚，但在具体计算和认定时，却未将补充协议的内容纳入考虑范围。这明显属于事实认定不清，因为补充协议作为原协议的补充和修改，其内容对双方的权利义务具有直接影响。一审法院未将其纳入判决范围，导致判决结果未能全面反映双方的真实意思表示和实际履行情况。
（二）补充协议的内容对案件结果具有决定性影响
补充协议中明确约定了双方在原协议基础上的新权利义务关系，包括但不限于付款方式、履行期限、违约责任等。这些内容对案件的结果具有决定性影响。一审法院未计算补充协议内容，导致判决结果未能准确反映双方的实际履行情况和法律责任。这不仅损害了上诉人的合法权益，也违背了法律的公平正义原则。
（三）二审法院应依法改判，并计算补充协议内容
鉴于一审判决存在上述错误，二审法院应依法撤销一审判决中未计算补充协议内容的部分，并重新计算和认定补充协议的内容。在此基础上，二审法院应作出公正判决，确保双方的权利义务得到准确反映和保护。同时，二审法院还应判令被上诉人承担本案的全部诉讼费用，以体现法律的公平正义和诉讼经济的原则。
四、撰写上诉状时的注意事项
若您在撰写上诉状过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。 我将根据您的具体情况，提供更为详细和专业的法律建议。