关于合作开发技术合同的登记问题，根据相关法律法规和政策要求，我来为您详细解答。
首先，合作开发技术合同属于技术开发合同的一种，它是指当事人之间就新技术、新产品、新工艺、新品种或者新材料及其系统的研究开发所订立的合同。根据《技术合同认定登记管理办法》以及相关税收优惠政策的规定，这类合同需要经过科技主管部门的登记。
那么，具体由哪一方进行登记呢？
在合作开发技术合同中，通常涉及技术输出方（即卖方）和技术吸纳方（即买方）。根据规定，在清远市辖区内注册的作为卖方（技术输出方）的法人单位、自然人（个人）和其他组织，应当负责进行技术合同的认定登记。如果涉外技术合同中外方为卖方，则可委托买方（需卖方出具授权委托书给买方）在其所在地进行认定登记。
登记的流程和要求：
准备材料：合同文本原件扫描件、技术方案（加盖申请单位公章）、费用构成清单（加盖公司章、财务章、项目负责人签字）以及其他根据需要提供的证明材料。
线上系统操作：技术合同登记全程线上系统操作，无需提交纸质材料。管理员维护单位信息，添加项目负责人（申请人），并进行登记设置，选择默认登记点。
受理和审核：二级登记点对当事人所提交的合同文本和有关材料进行初步审核和认定，主要事项包括是否属于技术合同、认定技术合同类型、核定技术性收入等。对符合要求的予以受理并提交至一级登记点；对不符合要求的，不予受理并说明理由。一级登记点对提交的合同文本和有关材料进行审核批复，对于批复通过的，进行签批，生成技术合同登记证明；对于不符合登记规定的，批复不通过并说明理由。
获取登记证明：属高新区的申请单位，可直接在系统下载登记证明；属其他辖区的申请单位，由登记点寄送纸质登记证明。
登记的重要性：
未申请认定登记或未予登记的技术合同，不得享受国家对有关促进科技成果转化规定的税收、信贷和奖励等方面的优惠政策。因此，进行技术合同登记对于合作双方来说都是非常重要的。
综上所述，合作开发技术合同通常由技术输出方（卖方）负责进行登记，如果涉外且外方为卖方，则可委托买方进行登记。希望这个解答能够对您有所帮助。