针对您提出的“男方起诉离婚，女方在医院生孩子，法院会怎么样决定”这一问题，以下是我的详细解答：

首先，我们需要明确的是，在女方孕期、分娩后一年内或中止妊娠后六个月内，男方通常是不被允许提出离婚的，这是为了保护女方和胎儿（或新生儿）的权益。然而，也存在一些例外情况，比如女方存在严重不利于孩子成长的行为，如长期吸毒等，此时法院可能会受理男方的离婚请求。

1. 关于离婚请求的受理：

   • 在您描述的情况下，女方正在医院生孩子，处于分娩后的特殊时期。因此，除非女方主动提出离婚，或者法院认为确有必要受理男方的离婚请求（比如存在上述提到的严重不利于孩子成长的行为），否则法院通常不会受理男方的离婚请求。

2. 关于子女抚养权：

   • 在子女抚养权的问题上，法院会以利于子女身心健康、保障其合法权益为出发点，综合考虑父母的抚养能力和条件等。由于孩子尚在哺乳期，原则上会随哺乳的母亲生活。当然，如果母亲存在传染性疾病等严重影响孩子健康的情况，抚养权可能会发生改变。

3. 关于夫妻共同财产分割：

   • 夫妻共同财产的分割会依据财产的具体情况，按照照顾子女、女方和无过错方权益的原则进行判决。如果一方存在隐匿财产等行为，在分割时可能会少分或不分。

综上所述，法院在处理此类案件时，会综合考虑案件的实际情况，包括女方的特殊时期、子女的抚养权以及夫妻共同财产的分割等问题。因此，具体判决结果会因案件的不同而有所差异。

最后，我想强调的是，离婚是一件严肃且复杂的事情，涉及到多方面的权益和责任。在做出决定之前，建议双方充分沟通、协商，并尽可能寻求专业的法律帮助，以确保自己的权益得到妥善保护。