员工在工作期间造成公司损失，需根据具体情况及法律规定来确定其赔偿责任。以下是对此问题的详细分析：
一. 损失与责任的确定
- 损失范围：首先，需明确损失的具体内容和金额，包括直接损失（如设备损坏、原材料浪费等）和间接损失（如声誉受损导致的业务减少）。
- 因果关系：必须证明公司的损失与员工的行为之间存在直接的因果关系，并排除不可抗力或不可预见因素导致的损失。
- 过错判断：根据员工的违规行为（故意、重大过失或一般过失）来判断其过错程度。一般过失通常被视为公司的经营风险，不要求员工承担赔偿责任。
二. 法律依据与赔偿方式
法律依据：
- 《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》规定，员工因故意或重大过失给用人单位造成损失的，应承担赔偿责任。
- 《工资支付暂行规定》第十六条明确了从工资中扣除赔偿费用的具体方式，但每月扣除部分不得超过工资的20%，且扣除后不得低于当地最低工资标准。
赔偿方式：
- 协商解决：首选与员工进行协商，根据损失情况和员工经济状况确定赔偿金额和方式。
- 从工资中扣除：在法律允许范围内，从员工工资中逐月扣除赔偿费用，确保扣除后的工资不低于当地最低工资标准。
- 法律途径：若员工拒绝承认错误或拒绝赔偿，公司可通过劳动争议仲裁机构或人民法院提起诉讼，要求员工承担赔偿责任。
三. 赔偿标准
- 故意造成的损失，员工应全额赔偿。
- 因重大过失造成的，按约定或协商确定赔偿比例。
- 一般过失无需赔偿。
综上所述，员工在工作期间造成公司损失时，公司应依法依规处理，根据员工的过错程度、损失大小及因果关系来确定赔偿责任和赔偿方式。同时，公司也应加强内部管理制度，提高员工的工作技能和责任意识，以预防类似情况的发生。如有进一步需要，您可以继续咨询我。