针对您提出的“国企三级子公司是由两家公司合资的合同和谁签”这一问题，以下是我的详细解答：
合同签订主体的确定：
- 合资协议的签订：当两家公司决定合资成立国企三级子公司时，它们首先需要签订一份合资协议（或称为合作协议、股东协议等）。这份协议将明确双方的权利、义务、出资比例、管理方式等关键条款。因此，合资协议的签订主体就是这两家合资公司。
- 子公司章程的制定：在合资协议签订后，双方将共同制定子公司的章程，章程中会规定子公司的组织结构、经营范围、股东权利等。但章程本身并非一份需要双方“签订”的合同，而是子公司设立和运营的基本规则。
- 子公司设立后的合同签订：子公司设立后，其作为独立的法人实体，将有权以自己的名义签订各类合同。这些合同的签订主体将是子公司本身，而非其股东（即那两家合资公司）。
关于合同签订的具体操作：
- 合资协议的谈判与签订：两家合资公司应就合资事宜进行充分谈判，明确各自的权利和义务，并最终签订合资协议。这份协议将作为双方合作的基础文件。
- 子公司设立过程中的文件签署：在子公司设立过程中，可能还需要签署一系列文件，如设立申请书、股东会决议等。这些文件的签署主体将根据具体情况而定，但通常涉及合资公司的代表或子公司筹备组的成员。
- 子公司运营后的合同管理：子公司设立后，应建立健全的合同管理制度，确保所有合同的签订、履行和变更都符合法律法规和公司章程的规定。
法律建议：
- 明确合同签订主体：在合资过程中，务必明确合同签订的主体，避免产生纠纷。合资协议应由两家合资公司直接签订，并明确双方的权利和义务。
- 完善子公司治理结构：子公司设立后，应完善其治理结构，确保子公司能够独立、有效地运营。这包括建立健全的董事会、监事会等机构，并明确各自的职责和权限。
- 加强合同管理：子公司应加强合同管理，确保所有合同的签订和履行都符合法律法规和公司章程的规定。同时，应定期对合同进行审查和更新，以适应市场变化和公司发展的需要。
综上所述，国企三级子公司作为由两家公司合资成立的独立法人实体，在设立过程中和设立后都将以自己的名义签订各类合同。但合资协议的签订主体则是这两家合资公司。如有任何法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。