公司做两套账是违法的。以下是对此问题的详细分析：

1. 违法性分析：

   • 根据《中华人民共和国公司法》第一百七十一条，公司除法定的会计账簿外，不得另立会计账簿。公司设置两套账，尤其是出于非法目的（如避税、财务造假等），显然违反了这一规定。
   • 同时，《中华人民共和国会计法》也明确规定，各单位必须根据实际发生的经济业务事项进行会计核算，不得做假账。设置两套账若涉及虚假记载或隐瞒真实情况，将违反会计核算的真实性原则。

2. 法律后果：

   • 若公司通过两套账隐瞒收入、虚增成本以逃避税款，将严重违反《中华人民共和国税收征收管理法》，构成偷税行为。税务机关将追缴税款、滞纳金，并处以高额罚款；情节严重时，还可能追究刑事责任。
   • 如公司通过两套账进行财务造假，情节严重的可能构成犯罪，如妨害清算罪、虚假破产罪等。这些罪行将导致直接负责的主管人员和其他直接责任人员面临有期徒刑、拘役及罚金等刑罚。

3. 合法情况下的多套账设置：

   • 虽然公司做两套账通常是违法的，但也有一些合法情况下的多套账设置。例如，企业出于管理需要，可能在同一会计主体内编制多套辅助账套，用于内部管理、决策支持等。只要这些账套的核算基础真实、未违反法律法规，且建账目的合法，则不构成违法。

4. 建议与防范：

   • 企业应严格遵守相关法律法规，确保会计信息的真实性和完整性。对于因管理需要而设置的多套账套，应确保其合法性、合规性，并接受相关监管部门的监督。
   • 财务人员应坚守职业道德准则，不要轻易接手“烂摊子”，避免因企业账目混乱而引火上身。同时，要不断学习新知识，掌握最新的税收政策，以降低法律和财务风险。

综上所述，公司做两套账通常是违法的，将面临严重的法律后果。企业应严格遵守相关法律法规，确保会计信息的真实性和完整性。如有任何法律问题或疑虑，可以直接向我咨询。