关于就业协议中约定的50000元违约金是否合法，这需要从多个角度进行分析。

1. 就业协议的性质：

   • 就业协议通常是毕业生与用人单位之间签订的一种意向性协议，它并非正式的劳动合同。因此，就业协议中的违约金条款并不直接受《劳动合同法》的严格约束，但也不能完全脱离法律框架。

2. 违约金的合法性判断：

   • 若就业协议中明确约定了违约金，并且该约定不违反法律法规的强制性规定：那么，在毕业生违约的情况下，用人单位有权要求毕业生支付约定的违约金。但需要注意的是，违约金的数额应当合理，不能过分高于用人单位因毕业生违约所遭受的实际损失。
   • 若就业协议中的违约金条款违反了法律法规的强制性规定：例如，用人单位利用就业协议中的违约金条款来限制毕业生的就业自由或进行不公平的交易，那么这样的违约金条款可能是无效的。

3. 50000元违约金的合理性分析：

   • 对于50000元的违约金数额是否合理，这需要根据具体情况来判断。如果用人单位为毕业生提供了特殊的培训、实习机会或其他有价值的资源，并且这些资源与毕业生的就业直接相关，那么50000元的违约金可能在一定程度上是合理的。
   • 然而，如果用人单位并未为毕业生提供任何特殊的资源或机会，或者提供的资源与毕业生的就业关系不大，那么50000元的违约金数额可能就过高了，存在不公平的风险。

4. 法律建议：

   • 对于毕业生而言，在签订就业协议前，应当仔细阅读协议条款，特别是关于违约金的约定。如果对违约金条款有疑问或认为其不公平，应当及时与用人单位沟通协商，或者寻求法律援助。
   • 对于用人单位而言，在设定违约金条款时，应当遵循公平、合理的原则，确保违约金的数额与毕业生违约所造成的实际损失相匹配。同时，用人单位也应当尊重毕业生的就业自由，不得利用违约金条款来限制毕业生的就业选择。

综上所述，就业协议中约定的50000元违约金是否合法，需要根据具体情况来判断。如果毕业生对违约金条款有疑问或认为其不公平，建议及时咨询专业律师以获取更准确的法律意见。如果你有进一步的法律问题或需要更详细的解答，可以直接向我咨询。