当您发现实发工资与劳动合同中的约定不一致时，这确实是一个需要认真对待的问题。以下是我为您提供的详细、有深度的处理步骤和建议：
一、核对与确认
仔细核对劳动合同：
- 首先，您需要仔细阅读劳动合同中关于工资的约定条款，包括工资结构（如基本工资、绩效工资、奖金等）、具体数额以及支付方式等。
确认实发工资情况：
- 接着，您需要核对实际收到的工资，包括工资条、银行转账记录等，以确认实发工资与劳动合同中的约定是否存在差异。
二、与用人单位协商
提出异议：
- 如果您发现实发工资与劳动合同中的约定不一致，应首先与用人单位的人力资源部门或相关负责人进行沟通，提出您的异议，并要求其说明原因。
要求补发差额：
- 如果确认是用人单位的违约行为，您有权要求其补发工资差额，并确保今后的工资支付符合劳动合同的约定。
三、向劳动监察部门投诉
准备投诉材料：
- 如果与用人单位的协商未能取得满意的结果，您可以准备相关证据材料（如劳动合同、工资条、银行转账记录等），向当地的劳动监察部门进行投诉。
配合调查：
- 劳动监察部门将会对您的投诉进行调查核实。在此过程中，您需要积极配合，提供必要的证据和信息。
等待处理结果：
- 如果调查情况属实，劳动监察部门将会责令用人单位改正，并补发您的工资差额。
四、申请劳动仲裁
准备仲裁材料：
- 如果劳动监察部门的处理未能满足您的要求，或者您认为涉及劳动报酬的争议较大，您可以向当地的劳动仲裁委员会申请劳动仲裁。
提交仲裁申请：
- 在提交仲裁申请时，您需要提供详细的仲裁请求、事实和理由，以及相关证据材料。
参与仲裁程序：
- 仲裁委员会将会安排开庭审理，您需要积极参与仲裁程序，陈述自己的诉求和理由，并提供证据支持。
等待仲裁结果：
- 仲裁委员会将会根据双方提供的证据和法律规定，作出仲裁裁决。如果裁决支持您的诉求，用人单位需要按照裁决结果履行义务。
五、法律诉讼（如需要）
对仲裁结果不服：
- 如果您对仲裁结果不服，可以在规定的时间内向法院提起诉讼。
准备诉讼材料：
- 在提起诉讼时，您需要准备详细的诉讼状和相关证据材料。
参与诉讼程序：
- 法院将会安排开庭审理，您需要积极参与诉讼程序，陈述自己的诉求和理由，并提供证据支持。
等待判决结果：
- 法院将会根据双方提供的证据和法律规定，作出判决。如果判决支持您的诉求，用人单位需要按照判决结果履行义务。
六、注意事项
保留证据：
- 在整个处理过程中，您需要妥善保留所有与工资支付相关的证据材料，以备不时之需。
了解法律法规：
- 您需要了解相关的法律法规和政策规定，以便更好地维护自己的合法权益。
保持冷静和理性：
- 在处理此类问题时，您需要保持冷静和理性，避免情绪化的行为影响问题的解决。
总之，当您发现实发工资与劳动合同中的约定不一致时，应首先与用人单位进行协商，并要求其说明原因并补发差额。如果协商不成，您可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。在整个处理过程中，您需要保留好相关证据材料，并了解相关的法律法规和政策规定。