关于土地使用权出让合同是民事合同还是行政协议的问题，这是一个在法律实践中经常被讨论的话题。以下是我对这个问题的详细解答：
首先，我们需要明确民事合同和行政协议的基本定义和区别。民事合同是平等主体之间设立、变更、终止民事权利义务关系的协议，它遵循的是意思自治、平等自愿的原则。而行政协议则是行政机关在进行行政管理和行政服务过程中，与个人、法人和其他组织签订的具有行政法意义上权利义务关系的协议。
接下来，我们分析土地使用权出让合同的性质。从所有权的角度出发，国家确实以国有资产为基础参与各种民事关系，但界定土地使用权出让合同的性质不能仅仅从这一点出发。我们需要看的是所有权为谁享有以及以何种方式处分。
属性由来：根据土地管理法、房地产管理法等相关法律法规，国有土地使用权出让的目的仍为实现土地资源使用管理，高效配置有限土地资源，这具有强烈的行政管理色彩。
行为性质：国有土地使用权出让行为实际上属于行政许可的转换形式。行政机关通过招标、拍卖等竞争性方式确定中标人、买受人后，应当作出准予行政许可的决定或者订立协议。这一程序体现了公开、公平、公正的原则，具有浓厚的行政法色彩。
法律规范：新修改的行政诉讼法将行政协议案件纳入到行政诉讼受案范围，这进一步明确了土地使用权出让合同的行政协议性质。同时，一些地方的行政程序规定也将国有土地使用权出让合同列为行政协议。
合同内容：国有土地使用权出让协议对建筑容积率、建筑密度等有强制性规定，这些规定体现了行政机关对土地使用的监管和管理，具有强烈的行政管理色彩。
履行方式：为了保证政府机关有效监督合同的履行，规定了其可以通过单方变更、解除合同无偿收回国有土地使用权和对违约行为进行征收土地闲置费、罚款等内容。这些规定也进一步体现了土地使用权出让合同的行政协议性质。
综上所述，土地使用权出让合同不属于民事合同，而是行政协议。即便合同中有约定仲裁条款，但根据现行法律规定，这个仲裁条款是无效的。一旦发生纠纷，应当依据行政方面的法律规定，依据《行政诉讼法》进行处理。
因此，对于用户提出的问题，我们可以明确回答：土地使用权出让合同是行政协议，不是民事合同。在处理相关纠纷时，应当遵循行政诉讼的程序和规定。