当机动车与非机动车发生事故，且机动车被认定为次要责任方时，保险赔偿的具体情况会涉及交强险和商业险两部分，以下是详细的解答：

一、交强险赔偿

在交强险的范围内，机动车有责任时，需要赔偿非机动车方最高12.1万元，这其中包括：

• 死亡伤残赔偿：最高1.1万元，用于覆盖因事故导致的伤残或死亡相关的费用。
• 医疗费用赔偿：最高1万元，用于支付非机动车方的医疗费用。
• 财产损失赔偿：最高2000元，用于赔偿非机动车方因事故导致的财产损失。

如果机动车被认定为无责任，则交强险的赔偿限额会降低至1.21万元。

二、商业险赔偿

超出交强险赔偿限额的部分，将由商业险按照责任比例进行赔偿。在主次责任划分中，次责方（即机动车方）通常需要承担30%左右的赔偿责任（具体比例可能因地区或保险公司条款有所不同，一般在20%-30%之间）。商业险的赔偿金额将根据实际的损失情况和保险条款来确定。

三、赔偿项目与计算

赔偿项目包括但不限于：

• 医疗费：以实际发生的金额为准。
• 误工费：根据受害人的误工时间和收入状况来确定。
• 护理费：如果受害人需要护理，将根据护理时间和护理费用标准来计算。
• 交通费：受害人因就医或转院治疗实际发生的合理交通费用。
• 残疾赔偿金：如果受害人因事故导致残疾，将根据伤残等级和相应标准来计算。

四、赔偿流程与注意事项

1. 及时报案：事故发生后，机动车方应及时向保险公司报案，并提供相关的事故资料和证明。
2. 保留证据：双方应妥善保留事故现场的照片、医疗诊断证明、费用发票等相关证据，以便后续理赔。
3. 协商与诉讼：如果双方对赔偿金额无法达成一致，可以通过协商或诉讼的方式来解决争议。

五、法律依据

机动车与非机动车主次责赔偿的法律依据主要是《道路交通安全法》及相关司法解释。根据这些法律规定，机动车与非机动车驾驶人、行人之间发生交通事故时，应根据过错程度来划分赔偿责任。

综上所述，当机动车与非机动车发生事故且机动车被认定为次要责任方时，保险赔偿将涉及交强险和商业险两部分，具体赔偿金额将根据实际的损失情况和保险条款来确定。在处理此类事故时，双方应遵守相关法律法规，并妥善保留相关证据以便后续理赔。