道路救援基金在保险公司赔付所有款项后，主要由交通事故责任人进行偿还。以下是对此问题的详细分析：

一. 偿还主体的确定

1. 交通事故责任人：

   • 根据相关法律法规，道路救助基金在垫付相关费用后，有权向道路交通事故责任人进行追偿。这意味着，在保险公司已经赔付所有款项后，若存在道路救助基金的垫付情况，责任人仍需承担偿还责任。
   • 例如，若张三在交通事故中负全责，导致李四受伤，救助基金为李四垫付了抢救费用。即使保险公司已经向李四赔付了所有款项，张三仍需向救助基金管理机构偿还这笔垫付费用。

2. 保险公司的角色：

   • 保险公司根据保险合同在责任限额内进行赔付。若保险公司已经按照合同约定赔付了所有款项，其赔付责任即告结束，不再涉及道路救助基金的偿还问题。

二. 法律依据

• 《机动车交通事故责任强制保险条例》第二十四条：明确规定了救助基金先行垫付的情形，并赋予救助基金管理机构向道路交通事故责任人追偿的权利。这表明，无论保险公司是否赔付，责任人都需承担偿还救助基金垫付费用的责任。
• 《中华人民共和国道路交通安全法》第七十五条：也强调了救助基金垫付后，其管理机构有权向交通事故责任人追偿。

三. 特殊情况处理

• 若责任人无力偿还或无法确定，则按照相关规定进行核销处理。但核销并不免除责任人的偿还义务，若发现其有偿还能力，救助基金管理机构仍可依法追讨。

总结：在保险公司赔付所有款项后，道路救援基金的偿还责任主要由交通事故责任人承担。这是基于相关法律法规的明确规定，也是救助基金制度得以有效运行的重要保障。因此，在事故处理过程中，应明确责任人的偿还义务，确保救助基金的及时回收和有效利用。如有进一步需要，您可以继续咨询我。