一个单位拥有两个不同字体的公章是不合法的。下面我将从法律依据、实践中的合法性边界、法律风险以及合规管理建议四个方面进行详细解释。

法律依据

根据《国务院关于国家行政机关和企业事业单位社会团体印章管理的规定》第三条，单位只能刻制一枚法定名称章（即公章），且需在公安机关备案后方可启用。这一规定明确了单位公章的唯一性和备案要求。

实践中的合法性边界

在实践中，单位使用多个公章的合法性需具体分析：

1. 业务专用章备案使用：若单位备案了公章、合同章、发票章等，并分别用于不同场景，这属于合法行为。
2. 分支机构独立用章：分公司在备案后使用自身公章签署文件，法律认可其效力。
3. 电子公章拓展：根据《电子签名法》，备案的电子公章与实体章具有同等效力，可视为合法“多章”形式。

然而，如果单位未经备案私刻公章，或使用与备案名称、样式不符的印章，以及超出专用章限定范围使用，则属于非法情形。

法律风险

1. 民事纠纷：若员工使用未备案公章签约，相对方有理由相信其有权代理时，单位需承担责任。
2. 行政责任：私刻公章可处警告、罚款，并收缴非法印章。
3. 刑事风险：私刻公章可能触犯伪造公司印章罪，最高可判三年有期徒刑。若用于诈骗、逃税等，将数罪并罚。

合规管理建议

1. 严格刻制与备案制度：确保所有印章（含电子章）在公安机关备案，分支机构用章需明确隶属关系。
2. 分级授权与使用监督：建立用章审批流程，限制专用章使用场景。
3. 技术防伪与追溯：采用芯片印章、区块链存证等技术，确保用章可追溯。
4. 法律培训与责任追究：定期对员工开展印章合规培训，明确违规用章责任。

综上所述，一个单位拥有两个不同字体的公章是不合法的，存在诸多法律风险。因此，建议单位严格遵守相关法律法规，确保公章的合法性和规范性使用。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。