签完店铺转让协议之后的流程主要包括以下几个步骤，我将为您详细展开说明：

一、商铺价值评估及测量

在签署完店铺转让协议之后，首先需要对商铺进行价值评估及测量工作。这一步骤是为了确保双方对商铺的实际价值有清晰的认识，并为后续的转让登记等环节提供准确的依据。评估工作通常由专业的评估机构进行，他们会根据商铺的地理位置、面积、装修状况等多个因素来综合评定其价值。

二、办理店铺转让公证（如需要）

如果双方认为有必要加强转让的法律效力，可以向相关公证机关提出申请，进行店铺转让公证事宜。公证机关会对转让协议的真实性、合法性进行审查，并出具公证书。这一步骤虽然不是必须的，但在某些情况下可以增加转让的可靠性和可信度。

三、向房地产管理部门提出申请

接下来，转让双方需要持房地产权属证书（如房产证）、当事人的合法证明（如身份证）、转让合同等有关文件，向房地产所在地的房地产管理部门提出申请，并申报成交价格。这一步骤是办理店铺转让登记手续的重要环节，也是确保转让合法有效的关键步骤。

四、房地产管理部门审查与现场查勘

房地产管理部门会对提供的有关文件进行审查，包括转让合同的合法性、当事人的身份证明等。同时，他们还可能对转让的房地产进行现场查勘和评估，以核实申报的成交价格是否真实合理。这一步骤通常需要一定的时间，具体时长可能因地区而异。

五、缴纳相关税费

在店铺转让过程中，转让双方需要按照规定缴纳相关税费。这些税费可能包括契税、增值税、印花税等，具体税种和税额可能因地区和政策的不同而有所差异。缴纳税费是转让流程中不可或缺的一环，也是确保转让合法有效的必要条件。

六、办理房屋权属登记手续

最后，当所有步骤都顺利完成之后，房地产管理部门会办理房屋权属登记手续，核发新的房地产权属证书。这意味着店铺的所有权已经正式从原所有人转移到新的所有人手中。至此，店铺转让流程全部结束。

在店铺转让过程中，还需要特别注意一些重要事项，如检查对方的身份证明文件、确认店铺所有权属于签约方、对店铺转让的原因及原责任人所负有的债权、债务情况进行详尽的调查研究等。这些注意事项都是为了确保转让的顺利进行和双方权益的保障。