针对您提出的问题，即公司高管辞职后公司未变更市场监管局会如何处理，以下是我给您的详细解答：
首先，根据《深圳经济特区商事登记条例》的相关规定，商事主体在明知登记事项错误或者已发生变化的情况下，拒不办理变更登记的，登记机关（如市场监管局）有权责令其限期改正。这意味着，如果公司高管辞职后，公司未及时进行相应的工商登记变更，市场监管局在得知此情况后，会要求公司限期改正这一错误。
具体处理流程可能如下：
责令改正：市场监管局在发现或接到举报后，会向商事主体（即公司）发出《责令改正通知书》，要求其在规定的时间内（最长15日）完成变更登记。
纠正登记：如果公司在整改期内仍未完成变更登记，市场监管局可以直接作出《纠正登记决定书》，依据职权或利害关系人的申请，依法纠正登记事项。这意味着，即便公司不主动变更，市场监管局也有权直接进行变更。
信息公示：完成纠正登记后，市场监管局会在24小时内通过国家企业信用信息公示系统更新相关信息，并公示处罚结果。这既是对公司的公开监督，也是保护消费者和投资者的知情权。
此外，从您提供的参考信息中也可以看出，如果公司已辞去董事职务的高管，应及时与企业联系，依照《公司法》与公司章程的约定选举新的董事并办理相应的变更流程。这是公司内部应尽的义务，也是确保公司登记信息准确性的重要步骤。
综上所述，如果公司高管辞职后公司未及时进行工商登记变更，市场监管局会依法进行干预，要求公司限期改正，并在必要时直接进行纠正登记。因此，建议公司在高管辞职后尽快办理相关变更手续，以避免可能的法律风险和信誉损失。