若冻结存款后查明与本案无关，司法机关应当在三日以内解除冻结。以下是对此问题的详细解释：

1. 解除冻结的法律依据：

   • 根据《中华人民共和国刑事诉讼法》及相关司法解释，特别是《公安机关办理刑事案件程序规定》第二百四十七条明确规定，对于冻结的存款、汇款等财产，经查明确实与案件无关的，司法机关应当在三日以内解除冻结。

2. 解除冻结的程序：

   • 司法机关在查明存款、汇款与案件无关后，不仅会解除冻结，还会及时通知原银行或其他金融机构执行解除操作，并通知被冻结存款、汇款的当事人，确保其知情权。

3. 财产权益的保护：

   • 这一规定旨在保护公民、法人和其他组织的合法财产权益，防止因司法机关的冻结行为而给当事人造成不必要的经济损失。

4. 实践操作建议：

   • 对于当事人而言，如发现自己的存款、汇款被错误冻结或冻结超过法定时限，应及时向相关司法机关提出异议并申请解冻。

综上所述，若您的存款被冻结后查明与本案无关，您有权要求司法机关在三日以内解除冻结。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。