首先，我们要明确一点：即使经过了你的允许，别人私自将车停放在你的耕地上，这也可能构成对你土地使用权的侵犯。现在，我来给你一些具体的处理建议：

1. 与对方沟通：

   • 首先，你可以尝试与对方进行友好沟通，明确表达你的不满和担忧，告知对方这是你的耕地，未经允许不得私自使用。
   • 询问对方为何将车停放在此，是否有其他合适的停车地点，并建议对方尽快将车移走。

2. 明确法律界限：

   • 如果沟通无果，你需要明确告知对方，根据《中华人民共和国土地管理法》等相关法律法规，你的耕地受法律保护，任何未经允许的使用都是违法的。
   • 你可以提及，如果对方继续侵犯你的土地使用权，你将不得不采取法律手段来维护自己的权益。

3. 寻求法律帮助：

   • 如果对方仍然无视你的警告，你可以考虑向当地的土地管理部门或农业农村部门投诉，请求他们介入处理。
   • 在必要时，你也可以咨询我这个专业律师，通过法律途径来维护你的合法权益。比如，你可以考虑向法院提起民事诉讼，要求对方停止侵权行为并赔偿损失。

4. 预防措施：

   • 为了避免类似情况再次发生，你可以在耕地周围设置明显的标识或围栏，明确表明这是私人土地，未经允许不得进入或使用。
   • 同时，你也可以与邻居或村委会等组织保持沟通，让他们了解你的土地使用情况，以便在出现问题时能够及时得到帮助和支持。

总之，面对别人私自将车停放在你的耕地上的情况，你应该首先尝试通过沟通来解决问题。如果沟通无果，你可以明确法律界限并寻求法律帮助来维护自己的权益。同时，也要采取预防措施来避免类似情况再次发生。