针对“违建时综合执法没收工具怎么处理”的问题，以下是我的专业解答：

核心结论：当综合执法部门在查处违法建设行为时没收了相关工具，当事人应当首先了解没收行为的法律依据，并按照规定配合执法部门的处理。同时，当事人也有权依法申请行政复议或提起行政诉讼，以维护自己的合法权益。

1. 了解没收行为的法律依据：

   • 综合执法部门在查处违法建设时，必须依据相关法律法规进行。没收工具作为一种行政强制措施，其执行必须严格遵守法律程序。
   • 当事人应当了解没收行为所依据的具体法律法规，如《城乡规划法》、《行政处罚法》等，以便明确自己的权利和义务。

2. 配合执法部门的处理：

   • 在工具被没收后，当事人应当保持冷静，积极配合执法部门的调查和处理。
   • 如需接受处罚，当事人应当按照执法部门的要求，及时履行相关义务，如缴纳罚款、整改违法建设等。

3. 申请行政复议或提起行政诉讼：

   • 如果当事人认为没收行为存在违法或不当之处，有权依法申请行政复议或提起行政诉讼。
   • 在申请行政复议或提起行政诉讼时，当事人需要提供充分的证据来支持自己的主张，并阐述清楚没收行为存在的具体问题。

4. 寻求专业法律帮助：

   • 在处理此类法律问题时，当事人可能会遇到诸多困难和挑战。因此，寻求专业律师的帮助是明智的选择。
   • 律师可以协助当事人了解法律法规、分析案情、准备证据材料，并提供专业的法律意见和代理服务。

综上所述，当综合执法部门在查处违法建设时没收了相关工具，当事人应当了解没收行为的法律依据，积极配合执法部门的处理，并在必要时依法申请行政复议或提起行政诉讼。同时，寻求专业律师的帮助也是维护自己合法权益的重要途径。