违法建设没收违法收入后的处理方式，主要依据《中华人民共和国城乡规划法》、《中华人民共和国土地管理法》及《中华人民共和国城市房地产管理法》等法律法规来进行。以下是对此问题的详细解答：

首先，对于违法建设所得的处理，根据违法行为的性质和情节，处理方式可能包括责令停止建设、限期改正、罚款、没收违法所得、限期拆除以及追究刑事责任等。在没收违法收入后，针对违法建设部分，应当采取强制拆除的措施。

具体来说：

1. 强制拆除的执行：

   • 有强制执行权的部门，如县级以上人民政府城乡规划主管部门或乡、镇行政机关，在没收违法收入后，对于无法采取改正措施消除影响的违法建设，应当先向县级以上人民行政机关申请，由县级以上行政机关责成后，方可实施强制拆除。
   • 无强制执行权的机关，则需要申请人民法院强制执行。

2. 执行协议的可能性：

   • 根据《中华人民共和国行政强制法》的相关规定，行政机关可以在不损害公共利益和他人合法权益的情况下，与当事人达成执行协议。这包括约定分阶段履行，以及当事人采取补救措施后可以减免加处的罚款或滞纳金。

3. 法律程序的遵循：

   • 在整个处理过程中，必须严格遵循《中华人民共和国行政处罚法》所规定的程序，包括立案、调查取证、告知权利、听证、作出处罚决定、送达等，以确保处理过程的合法性和正当性。

此外，值得注意的是，违法收入的计算和没收程序也是非常重要的环节。违法收入的计算通常按照新建、扩建、改建的建筑物出售所得价款来计算，如果价款明显低于市场价，则需通过评估来确定。同时，没收程序也必须严格依法进行，确保当事人的合法权益得到保障。

综上所述，违法建设没收违法收入后的处理方式是一个综合考量的过程，需要依据相关法律法规进行，并确保整个处理过程的合法性和正当性。同时，加强预防和监管工作也是减少违法建设发生的重要手段。