面对政府没收违建后的处理问题，这确实是一个涉及法律程序、权益保障以及城市规划管理等多个方面的复杂议题。以下是我为您详细梳理的解答：
一、对于违建所有者
确认违建认定的合法性
- 审查认定程序：您需要仔细检查政府在认定违建时是否遵循了法定程序，比如是否进行了现场勘查、是否下达了正式通知、是否给予了您陈述申辩的机会等。如果发现程序存在违法或不合理之处，您有权通过行政复议或行政诉讼来维护自己的权益。
- 核查法律依据：同时，您也需要核实政府所依据的法律法规是否准确适用，特别是考虑到地区差异和历史背景，比如农村地区因规划管理不完善可能导致的早年建筑问题。
应对策略
- 自行拆除或整改：如果建筑确实属于违建，且您无法推翻政府的认定，那么积极配合政府，按照要求自行拆除或整改是减少损失和执法成本的有效方式。
- 申请合理补偿：如果您在建筑上的投入是基于合理信赖和对规定的不了解，那么您可以尝试与政府沟通，申请在合理范围内给予一定的补偿。
寻求法律救济
- 行政复议：如果您对政府的没收决定不服，可以在规定期限内（一般为60日）向上一级行政机关或同级人民政府申请行政复议。
- 行政诉讼：如果行政复议的结果不能令您满意，或者您直接选择诉讼途径，那么您可以在规定期限内（一般为6个月）向人民法院提起行政诉讼。在此过程中，请务必注意收集和整理相关证据。
二、对于政府部门
依法依规进行没收处理
- 严格遵循法定程序：政府在没收违建时，必须确保调查取证、通知下达、陈述申辩权利告知等环节均符合法律规定。
- 妥善保管没收财物：政府需要建立完善的保管制度，确保没收财物的安全和完整，并详细登记以便后续处理和管理。
后续处置工作
- 合理利用没收财物：根据违建的实际情况，政府可以将其用于公共服务设施、绿化用地等符合城市规划的用途，以实现资源的合理利用。
- 拆除严重违建：对于存在严重安全隐患、无法整改或严重影响城乡规划的违建，政府应依法进行拆除，并妥善处理建筑内的物品，保障当事人的合法权益。
- 用于保障性住房等民生项目：对于符合条件的住宅类违建，政府可以考虑将其纳入保障性住房体系，以解决低收入家庭的住房困难。
确保操作合法性与公正性
- 听取当事人意见：在没收决定作出后，政府应认真听取当事人的异议和诉求，并根据实际情况作出相应处理。
- 加强宣传教育：通过没收违建事件，政府应加强对相关法律法规的宣传教育，提高公众的法律意识和规划意识。
三、综合处理方式
没收违建后的处理方式并非一成不变，而是需要根据违建的性质、价值、安全隐患以及对城乡规划的影响等因素进行综合考虑。政府可以采取政府自用、拍卖或公开转让、拆除以及用于保障性住房等民生项目等多种方式进行处理。无论采取哪种方式，都必须确保整个处理过程依法依规进行，并充分保障当事人的合法权益。
希望以上解答能够对您有所帮助。如果您在处理违建没收问题时遇到任何困难或疑问，建议及时咨询专业律师或相关政府部门以获取更具体的指导和帮助。