维修基金在卖房时被收走是合法的。以下是详细分析：
一. 维修基金的性质与用途
- 维修基金是专项用于物业保修期满后物业共用部位、共用设施设备维修和更新、改造的资金。
- 它的设立目的是为了保障物业的长期使用和业主的共同利益。
二. 维修基金在房屋转让中的处理
- 根据相关法律法规，房屋所有权转让时，业主应当向受让人说明住宅专项维修资金交存和结余情况并出具有效证明。
- 该房屋分户账中结余的住宅专项维修资金随房屋所有权同时过户，即维修基金会随着房屋的交易而转移给新的业主，继续用于该房屋共用部位、共用设施设备的维修等事宜。
三. 特殊情况下的处理
- 如果在房屋交易过程中，原业主与新业主之间另有约定，且该约定不违反法律法规的强制性规定，比如约定将维修基金退还或做其他处理，那么可以按照约定执行。但这种约定需要双方自愿、平等、合法，并需在相关部门进行备案或办理相应手续。
综上所述，维修基金在卖房时被收走是合法的，因为它会随房屋所有权一并转移给新的业主，用于保障物业的维修和更新。当然，如果双方有特殊的约定，并且该约定合法有效，也可以按照约定来处理维修基金。我建议在房屋交易中，双方应明确维修基金的处理方式，以避免不必要的纠纷。如有进一步需要，您可以继续咨询我。