自然人承包工程确实有依法纳税的义务。

在建设工程领域，无论是企业还是自然人，只要承包了工程并获得了收入，就需要根据国家的税收法律法规，履行纳税义务。这是国家税收制度的基本要求，也是维护社会公平和经济秩序的重要保障。

具体来说，自然人承包工程后，需要根据其所得收入的性质和金额，向税务机关申报并缴纳相应的税款。这些税款可能包括增值税、个人所得税等。增值税是对商品和服务在流转过程中产生的增值额征收的一种税，而个人所得税则是对个人所得收入征收的一种税。

如果自然人未依法履行纳税义务，可能会面临税务机关的处罚，包括罚款、滞纳金等。严重的，还可能构成逃税罪，需要承担刑事责任。

因此，自然人承包工程时，务必了解并遵守国家的税收法律法规，确保依法纳税，避免不必要的法律风险。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。