单独确认劳动关系是否可以调解结案，在司法实践中存在较大争议。以下是对此问题的详细分析：
可以调解的观点：
- 劳动关系确认是明确双方劳动关系的关键环节，它是可以进行调解的。调解作为解决纠纷的一种途径，在劳动关系确认中发挥着重要作用。双方可以借助调解机构或调解人员，进行沟通交流，表达各自的意见和诉求，努力达成一致。
- 调解具有灵活性和保密性，能避免诉讼所带来的时间与成本的大量消耗，还有利于维护双方的关系。调解人员会依据相关法律法规和劳动政策，引导双方以理性的态度看待问题，为他们提供专业的建议和解决方案。
不可以调解的观点：
- 劳动关系是劳动者和用人单位权利与义务的基础，制作调解书的前提是双方的劳动关系的认定没有问题。然而，涉及确认劳动关系的纠纷，对于双方的权利、义务并不明确。有时，当事人可能会利用调解掩盖非法目的，比如在没有实际劳动事实的情况下达成调解协议，虚构劳动关系，以此来缴纳保险或享受待遇等。
- 确认劳动关系可能涉及到工伤认定、社会保险缴纳等多种实际权益。如果劳动者和企业串通起来确认劳动关系，可能会损害其他相关方的利益。因此，裁判机构对于当事人申请的“因确认劳动关系发生的争议”持审慎态度，并逐渐形成了确认劳动关系纠纷不能调解的惯例。
- 有观点认为，确认劳动关系纠纷是身份关系确认案件，根据《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民事诉讼法〉的解释》第一百四十三条，涉及身份关系的案件不得调解。
综上所述，单独确认劳动关系是否可以调解结案，并没有明确的法律规定，而是取决于具体的司法实践和仲裁委、法院的判断。在实际操作中，若双方分歧过大或涉及复杂的权益关系，可能需要通过劳动仲裁或诉讼等法律途径来解决。若您有此类纠纷，建议咨询当地劳动仲裁委或法院，以获取更具体的指导和帮助。