关于商铺出租后被注册公司，业主要承担什么责任的问题，我们可以从以下几个方面进行分析：
一般情况下业主的责任：
- 在大多数情况下，如果商铺的出租合同中没有明确禁止承租人在商铺内注册公司，那么业主通常不会因为承租人注册公司而承担额外的责任。业主的主要责任是确保商铺的租赁条件符合合同约定，以及按照合同约定收取租金。
合同中有特殊约定的情况：
- 如果租赁合同中明确规定了关于在商铺内注册公司的相关条款，比如禁止注册某些类型的公司、需要业主同意才能注册等，那么业主就需要根据这些条款来履行自己的责任。如果承租人违反了这些条款，业主有权根据合同采取相应的法律措施。
涉及商铺用途变更的情况：
- 如果承租人注册的公司类型与商铺的原定用途不符，比如将原本用于零售的商铺用作工业生产，这可能会涉及到商铺用途的变更。在这种情况下，业主需要关注当地法律法规对于商铺用途变更的规定，以及租赁合同中是否有关于用途变更的条款。如果承租人未经允许擅自变更商铺用途，业主可能需要承担一定的监管责任，但具体责任还需根据法律法规和合同条款来判断。
涉及行政责任或刑事责任的情况：
- 在极少数情况下，如果承租人注册的公司从事违法活动，比如诈骗、非法集资等，并且这些活动是在业主知情或者应当知情的情况下进行的，那么业主可能会因为疏于管理或者提供场所给违法活动而承担一定的行政责任或刑事责任。但这种情况比较罕见，且需要具体的法律事实和证据来支持。
综上所述，商铺出租后被注册公司，业主要承担的责任主要取决于租赁合同中的约定以及当地法律法规的规定。在大多数情况下，业主不会因为承租人注册公司而承担额外的责任，但也需要关注租赁合同的条款以及商铺的实际使用情况，以确保自己的权益不受损害。如果你有更具体的情况或者疑问，可以直接向我咨询。