怀孕期间公司降薪是不合法的。
法律分析：
基本权益保护：根据《中华人民共和国劳动法》及《中华人民共和国妇女权益保障法》的相关规定，女职工在怀孕期间享有特殊的法律保护。这些法律明确规定，用人单位不得因女职工怀孕而降低其工资、予以辞退或与其解除劳动（聘用）合同。
合同变更原则：根据《中华人民共和国劳动合同法》，劳动合同的变更需要用人单位与劳动者协商一致，并采用书面形式。如果公司未经与女职工协商，单方面降低其工资，这违反了劳动合同变更的法定原则。
特殊保护规定：《女职工劳动保护特别规定》进一步强调了用人单位不得因女职工怀孕、生育、哺乳而降低其工资或与其解除合同。这一规定体现了对女职工在特殊生理时期的特别关照和保护。
特殊情况：
尽管法律规定了不得降低怀孕女职工的工资，但也存在特殊情况。如果用人单位能够证明女职工在怀孕期间不能胜任原工作岗位，并且经过培训或者调整工作岗位后仍不能胜任工作，那么根据公司合法有效的规章制度进行合理的岗位和工资调整可能是被允许的。然而，这种情况下，用人单位需要承担严格的举证责任。
应对措施：
协商沟通：女职工首先可以尝试与公司进行协商沟通，要求公司恢复工资待遇。这是解决纠纷的一种温和且有效的方式。
法律途径：若协商不成，女职工可以依法向当地的劳动监察部门投诉、举报或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。在此过程中，建议咨询专业的法律人士以获取更具体的法律指导和支持。
综上所述，公司在员工怀孕期间擅自降低其工资是不合法的行为，除非存在特殊情况并经过严格的举证程序。女职工应当了解自己的合法权益，并在遭遇此类问题时采取适当的措施来维护自己的利益。如果您有进一步的法律问题或需要更详细的法律建议，请直接向我咨询。