结论前置：分包商的工程款支付责任，通常应由总包商承担。但在总包被甲方赶出，甲方直接指挥分包商继续施工的特殊情况下，分包商的工程款支付责任需根据具体情况分析，可能由甲方或总包商承担，或二者共同承担。

分析说明：

1. 总包商与分包商的合同关系：

   • 在正常的建设工程合同中，总包商与分包商之间存在明确的合同关系，分包商的工程款通常由总包商支付。
   • 若总包合同被解除或终止，但分包工程已完成且质量合格，分包商仍有权要求总包商支付工程款。

2. 甲方直接指挥分包商施工的影响：

   • 甲方在总包商被赶出后直接指挥分包商继续施工，可能构成对原合同关系的变更或新的合同关系。
   • 若甲方与分包商之间形成了新的合同关系或事实合同关系，且双方就工程款支付达成了新的约定，则分包商有权要求甲方支付工程款。
   • 若甲方并未与分包商形成新的合同关系，但默认或接受分包商继续施工，并实际受益于分包商的劳动成果，则甲方可能因不当得利而承担支付工程款的责任。

3. 法律责任判断：

   • 需审查总包合同、分包合同以及甲方与分包商之间的实际行为，以确定是否存在有效的合同关系及支付义务。
   • 若总包商仍对分包工程承担法律责任，则分包商有权要求总包商支付工程款。
   • 若甲方实际参与了分包工程的指挥和管理，并从中受益，则甲方可能需承担支付工程款的责任，或与总包商共同承担。

4. 建议与措施：

   • 分包商应首先与总包商沟通，明确工程款支付事宜，并尝试通过协商解决。
   • 若协商无果，分包商可依据合同及相关证据，向法院提起诉讼或申请仲裁，要求总包商或甲方支付工程款。
   • 在诉讼或仲裁过程中，分包商应充分举证证明其施工事实、工程质量及欠款情况，以维护自身合法权益。

综上所述，分包商的工程款支付责任需根据具体情况分析，可能由甲方或总包商承担，或二者共同承担。分包商应依据合同及相关证据，积极维护自身合法权益。如有进一步疑问或需要法律帮助，请直接向我咨询。