国有企业替民营企业代持股份的合法性，需根据具体情况进行综合判断。以下是对此问题的详细分析：
合法性分析：
- 法律法规未明确禁止：我国现行法律法规并未直接禁止国有企业代持民营企业股份的行为。在“法无禁止即可为”的原则下，此类代持行为在法律层面有一定的存在空间。
- 符合国资监管规定：国有企业进行股权代持时，必须严格遵守国有资产监督管理的相关规定，包括审批、备案等程序，以确保国有资产的安全和保值增值。代持行为应基于正当的商业目的和合理的交易安排，并经过国有企业内部决策程序和上级主管部门的批准。
- 代持协议有效性：国有企业与民营企业之间签订的代持协议，若满足《民法典》关于民事法律行为有效的条件，即行为人具有相应的民事行为能力、意思表示真实、不违反法律强制性规定、不违背公序良俗，则该协议在双方之间具有法律效力。
法律风险分析：
- 违反国资监管政策：若代持行为未经必要的审批和备案程序，或未按照规定对代持股份进行评估，可能导致国有资产流失的风险，相关责任人可能受到行政处分甚至被追究刑事责任。
- 利益输送风险：代持行为可能被用于掩盖不正当的利益输送，如通过代持股份操纵利润分配，将国有企业的利益转移给民营企业或个人，这种行为将构成违法犯罪。
- 代持协议无效风险：如果代持协议存在违反法律、行政法规强制性规定的情形，如规避国家对特定行业的准入限制或税收监管，该协议可能被法院认定为无效，导致代持双方的权益无法得到法律保障。
综合建议：
- 在进行代持前，国有企业和民营企业应进行充分的风险评估和合规审查，确保代持行为的合法性和合规性。
- 应建立完善的管理机制和监督机制，以防范潜在的法律风险和管理风险。
- 如遇具体问题或争议，建议及时向我咨询，以获取准确的法律意见。
综上所述，国有企业替民营企业代持股份的合法性并非一成不变，而是需根据具体情况和法律法规进行综合判断。在实际操作中，建议谨慎行事，确保代持行为的合法合规性。