人力资源公司代发工资是合法的。在劳动关系中，虽然用人单位通常有义务直接向劳动者支付工资，但在一些特定情况下，委托第三方机构，如人力资源公司代发工资，是被允许的。这种做法在许多企业中很常见，主要是为了提高工资发放的效率和准确性。

从法律角度看，代发工资的行为需要符合以下几个条件才能确保其合法性：

1. 合法的委托关系：用人单位与代发机构需签订明确的委托协议，明确双方的权利和义务，以保障工资代发的有序进行。
2. 工资来源合法合规：用人单位提供的工资资金必须是通过合法经营、合规财务渠道获得的。
3. 保障劳动者权益：代发过程中要保证工资按时、足额发放到劳动者账户，不得克扣、拖欠工资，并且要严格保护劳动者的个人信息安全。

如果代发工资过程中存在如虚构代发事实以逃避税收、利用代发侵害劳动者权益等违法违规行为，那么这种行为是不合法的，相关责任主体将面临法律责任追究。

总之，只要代发工资的行为符合上述法律法规的规定，就是合法的。如果您在代发工资过程中遇到任何问题，如工资拖欠、发放错误等，可以依据相关法律法规向用人单位或代发工资机构主张自己的权益。