国有土地的院落空地补偿主要依据的是《最高人民法院关于征收国有土地上房屋时是否应当对被征收人未经登记的空地和院落予以补偿的答复》。这一答复中明确规定，在国有土地上房屋征收补偿中，应将当事人合法享有国有土地使用权的院落、空地面积纳入评估范围，并按照征收时的房地产市场价格一并予以征收补偿。

这一规定的重要性在于，它直接推翻了以往许多地方“只补房不补地”的潜规则，确保了被征收人手中的“隐藏资产”得到法律保障。补偿的计算方式通常涉及市场评估法、成本逼近法或基准地价修正法，具体方法会根据空地的具体情况和所在区域的市场价格等因素来确定。

在政策因素和协商谈判方面，政府的补偿政策对空地补偿具有重要影响，因此了解并遵循当地最新政策至关重要。同时，补偿金额往往通过协商和谈判来确定，土地使用权人可以提出合理的补偿要求，并与政府相关部门进行沟通协商。

如果无法就补偿问题达成一致，土地使用权人有权依法申请行政复议或提起行政诉讼，以维护自身的合法权益。在此过程中，建议咨询专业律师或法律顾问，以获得专业的法律支持和指导。

总的来说，国有土地的院落空地补偿是一个涉及多个法律和政策因素的问题，需要综合考虑相关法律法规、土地使用权性质、市场评估、政策导向以及协商谈判等多方面因素来确保补偿的公平合理。