针对您提出的“厂房合同是个人签的，但使用登记证是公司的章”这一问题，这里有几个核心点需要明确和考虑，我会尽量给您一个全面且清晰的解答。

首先，核心结论在于：这种情况可能会涉及到合同主体与实际使用主体不一致的法律问题，需要具体分析合同内容、签约双方的意图以及实际履行情况来确定法律责任和权益归属。

1. 合同主体问题：

   • 如果厂房合同是以个人名义签订的，那么理论上合同的权利和义务应由该个人承担。但如果合同中明确约定了公司作为实际履行方或受益方，并且公司也盖章确认了使用登记证，这可能构成一种隐名的代理关系，即个人作为公司的代理人签订合同。
   • 在这种情况下，需要查看合同中是否有关于代理或代表公司签订合同的明确条款，以及公司是否通过其他方式（如内部决议、授权委托书等）对个人的签约行为进行了追认。

2. 使用登记证的公司章问题：

   • 使用登记证上加盖的是公司的章，这表明公司至少在一定程度上参与了厂房的使用或管理。这可能与合同中的约定相符，也可能存在超出合同范围的额外行为。
   • 如果公司未经个人同意或授权就擅自使用厂房，这可能构成对个人合同权益的侵犯，或者构成违约行为。

3. 法律责任和权益归属：

   • 在确定法律责任和权益归属时，需要综合考虑合同的具体内容、双方的实际履行情况、以及是否存在其他相关证据（如邮件往来、会议记录等）。
   • 如果双方对合同主体或实际履行存在争议，可能需要通过法律途径（如诉讼或仲裁）来解决。

4. 建议措施：

   • 首先，建议您仔细审查合同文本，特别是关于合同主体、代理权限、履行方式等关键条款。
   • 其次，尝试与对方（个人或公司）进行沟通，了解双方的意图和期望，看是否能够通过协商达成一致。
   • 如果无法协商解决，或者您认为自己的权益受到了侵害，可以考虑寻求法律帮助，通过法律途径来维护自己的合法权益。

总之，这种情况下的法律责任和权益归属需要根据具体情况来确定。如果您需要更详细的法律分析或建议，请随时向我咨询。