针对你提出的“自来水抄表员因个人因素造成公司损失46万会怎么处理”的问题，我们可以从法律和公司内部管理两个角度来分析。
首先，从法律角度来看：
责任认定：如果自来水抄表员的行为构成职务侵权或者违反了相关法律法规（如刑法中的贪污、职务侵占等），那么他将承担相应的法律责任。这包括但不限于刑事责任、民事赔偿责任等。
法律程序：公司可以通过法律途径追究抄表员的责任，比如提起民事诉讼要求赔偿损失，或者报警由公安机关立案侦查并提起公诉。
证据收集：在处理此类案件时，证据的收集至关重要。公司需要保留相关证据，如抄表记录、财务账目、监控录像等，以证明抄表员的行为与损失之间的因果关系。
其次，从公司内部管理角度来看：
内部调查：公司应首先进行内部调查，查明损失的具体原因、抄表员的具体行为以及是否存在其他相关责任人员。
纪律处分：根据调查结果，公司可以对抄表员进行纪律处分，如警告、罚款、降职、解雇等。如果抄表员的行为构成严重违纪，公司有权解除与其的劳动合同。
预防措施：为了避免类似事件再次发生，公司应加强对抄表员等关键岗位人员的培训和管理，完善内部控制制度，加强监督和审计。
综上所述，自来水抄表员因个人因素造成公司损失46万，公司可以从法律和公司内部管理两个角度来处理。在法律方面，公司可以追究抄表员的法律责任并要求赔偿；在内部管理方面，公司可以进行内部调查、给予纪律处分并采取预防措施。如果你还有其他相关问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。